由于用荧光来测量样品的浓度都比较低，因此很容易受各个因素的影响，一般空白高于经验值多半是所用器皿污染、试剂污染或者是仪器本身污染造成的。
器皿污染：一般换用可以确定的没有被污染的器皿，重新配制相同浓度载流和还原剂，取部分溶液放于被怀疑的器皿内，上机测量，两者荧光值相差很大，则高的那组使用的器皿被污染。
试剂污染：一般为酸污染，多数是因为所用酸的纯度不够。
检验方法如下：配制2%的酸和4%～10%的酸，上机测量，对比这两种不同浓度酸所出荧光值，若成倍或是更高则高浓度的此酸被污染，需更换新瓶酸或其他厂家的酸。(一般正规厂家的酸空白都很低，而且10%和2%两种浓度酸所测的荧光值不会差太多)。
仪器本身的污染：由于进高浓度的样品或标液引起再次测空白时，很难清洗到被污染前的状态，一般汞*容易被污染，仪器被高浓度汞溶液污染后，可配制10%硝酸+0.04%重铬酸钾混合溶液作为载液清洗仪器，达不到清洗效果时需更换管路。(养成每天做完实验及时用水清洗的习惯)。
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