人肿瘤lncRNA芯片 sp-TWCPAHM-0011

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产品型号：sp-TWCPAHM-0011

品牌：上海启因生物科技有限公司

公司名称：上海启因生物科技有限公司

所在地：上海虹口

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产品简介

人肿瘤lncRNA芯片检测服务。长链非编码RNA(Longnon-codingRNA,lncRNA)是长度大于200个核苷酸的非编码RNA。 研究表明,lncRNA在表观遗传调控、细胞周期调控和细胞分化调控等众多生命活动中发挥重要作用，成为生物学医学研究热点 。启因生物人肿瘤lncRNA芯片包含84个人肿瘤相关lncRNA芯片，满足不同科研需要。

产品详细信息

人肿瘤lncRNA PCR芯片

PCR ARRAY介绍

PCR ARRAY又称PCR芯片，运用高通量荧光定量PCR方法，在一张96孔或384孔板上同时对某个信号通路或相关基因的表达量变化进行检测，芯片上的基因包括了与研究对象有确定关系的基因或者待考证的基因；目前启因生物针对不同的信号通路相关基因设计了150多款功能分类PCR芯片，涵盖生命科学研究的各个领域。

人肿瘤lncRNA PCR芯片介绍

启因生物的人肿瘤lncRNA PCR ARRAY含有84个人肿瘤lncRNA 相关基因，包括：乳腺癌，肺癌，卵巢癌，神经母细胞瘤，黑色素瘤，胆囊癌等数十种肿瘤或癌症类型。

产品说明

产品名称	人肿瘤lncRNA PCR芯片
英文名称	Human Glucose Metabolism PCR Array
货号	sp-TWCPAHM-0011
基因数目	84个
基因名称	见基因列表
检测费用	800元（活动价）
样本类型	细胞，组织等
项目周期	2周（不含节假日）
实验结果	原始数据，数据分析
技术原理	*相对定量，SYBR Green法

*相对定量：用于测定一个测试样本中目标基因与校正样本中同一基因表达的相对变化。校正样本可以是一个未经处理的对照或者是在一个实验研究中处于零时的样本。

服务特点

1. 只需提供样品

2. 数据分析多样性选择

3. 中低通量，一次性检测多个相关基因的表达水平

4. 周期短

5. 结果不需要qPCR验证

服务流程

1. 确定实验方案，签合同

2. 样品寄出（-80℃顺丰寄出）

3. 收样后进行质控

4. 质控过关，上机检测

5. 数据分析

样品预处理方法

为了避免样品中RNA降解，需对样品进行预处理。

样品类型	处理方法	送样量
贴壁细胞	①倒出培养液，用 1×PBS 清洗一次。 ② 每 10 cm²生长的培养细胞中加入 1-2 ml 的trizol，轻微晃动，确保使裂解液均匀分布于细胞表面。③ 将内含细胞的裂解液转移至离心管中，-80℃保存	至少1×10⁶个细胞
悬浮细胞	①将悬浮培养细胞连同培养液一起倒入离心管中，8,000 g 4℃离心2 分钟，弃上清。 ② 向细胞中加入 1 ml 的 trizol，-80℃保存	至少1×10⁶个细胞
组织（动物器官类）	离心管中加1 ml 的 trizol，确保浸没组织，-80℃保存	至少20mg,约小黄豆大小

检测流程：

1. 样品总RNA提取

2. RNA质量检测，检测RNA纯度及完整度，提供RNA质量报告；

3. cDNA合成，使用逆转录酶，将样品RNA逆转录为cDNA；

4. 实时定量PCR反应；

5. 数据分析，计算PCR芯片中的各个Ct值，采用ΔΔCt方法比较基因的表达变化，并利用公司自主开发的数据分析软件进行比较。

数据图
	火山图——是在一张图中利用P值和表达差异值分析做图，可以非常的直观且合理地筛选出在两样本间发生差异表达的基因。
	维恩图——不同的实验组（集合）之间的基因的相互关系。
	柱状图——能够直观的反映不同样本的基因表达情况的差异。
	散点图——用两组数据构成多个坐标点，考察坐标点的分布，判断两变量之间是否存在某种关联或总结坐标点的分布模式。
	热图——热图是对实验数据分布情况进行分析的直观可视化方法，可以用来进行实验数据的质量控制和差异数据的具像化展示，还可以对数据和样品进行聚类，观测样品质量。

基因列表

7SK	DAOA-AS1	IGF2-AS	PCAT19
7SL	DGCR5	IPW	PCGEM1
ASFMR1	DISC2	KCNQ1DN	PDZRN3-AS1
ATP6V1G2-DDX39B	DLEU1	KCNQ1OT1	PISRT1
ATXN8OS	DLEU2	LINC00032	PRINS
BACE1-AS	DLX6-AS1	LINC00162	PTCSC1
BCAR4	DNM3OS	LINC00271	PVT1
BCYRN1	DSCAM-AS1	LSAMP-AS3	RMST
BDNF-AS1	EPB41L4A-AS1	MALAT1	SCAANT1
BOK-AS1	ESRG	MEG3	SNHG11
BPESC1	FMR4	MESTIT1	SNHG3
CASC2	GAS5	MIAT	SNHG4
CBR3-AS1	GDNFOS	MIR100HG	SNHG5
CCAT1	H19	MIR155HG	SOX2-OT
CDKN2B-AS1	HAR1A	MIR17HG	SPRY4-IT1
CECR3	HAR1B	MKRN3-AS1	SRA1
CECR9	HIF1A-AS1	MYCNOS	TCL6
CERNA2	HOTAIR	NAMA	TDRG1
CHL1-AS2	HOXA11-AS	NEAT1	TERC
CRNDE	HYMAI	PCA3	TP53COR1
CUDR	IFNG-AS1	PCAT1	TRAF3IP2-AS1

（更多芯片基因列表可上www.pcrarray.cn查询）

参考文献

Zhu J J, Liu Y F, Zhang Y P, et al. VAMP3 and SNAP23 mediate the disturbed flow-induced endothelial microRNA secretion and smooth muscle hyperplasia[J]. Proceedings of the National Academy of Sciences, 2017, 114(31): 8271-8276. (IF9.661)

Zheng H S, Guo W Q, Wu Q L, et al. Electro-peroxone pretreatment for enhanced simulated hospital wastewater treatment and antibiotic resistance genes reduction[J]. Environment international, 2018, 115: 70-78. (IF7.088)

Pu C, Liu H, Ding G, et al. Impact of direct application of biogas slurry and residue in fields: In situ analysis of antibiotic resistance genes from pig manure to fields[J]. Journal of Hazardous Materials, 2018, 344: 441-449.（IF6.065）