DI系统运行过程中，因进水水质波动或EDI电源故障等因素造成EDI系统的膜块内部的树脂被离子消耗尽的时候，就会影响到产水水质，为了使EDI膜块恢复初始性能状态，这时需要再生处理。EDI模块再生过程就是将树脂中多余的离子带出膜块，通过在短时间内大幅度地改变系统操作参数，将树脂中多余的离子从淡水室迁移到浓水室，从而被浓水带出EDI膜组件。
一般调节系统的水量及运行电流，提高电流至运行电流的150%-200%（不得超过6A），水量减少1/3，然后运行膜块。再生处理时需留意以下技术参数：1、运行电流在规定范围内；2、进水水质满足要求；3、确保进水压力在规定范围之内；4、确保进水流量尤其是极水流量不低于要求；5、确保淡水、浓水进水压力递减。
再生过程中EDI产水水质开始会有所下降，随着再生的不断进行产水水质会缓慢回升，继续运行4-20小时，水质恢复后此时EDI膜块完成再生，出水水质恢复正常水平，调整技术参数至正常操作参数。
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