荧光定量 PCR 的应用范围，具体来说可以分为以下几个方面：

（1）分析点突变和等位基因荧光定量PCR可以进行点突变分析和等位基因分析，用不同的荧光报告基团标记Taqman探针，然后分别与野生型和突变型杂交，如果一种荧光信号明显强于另一种荧光信号，则表明它是纯合子；如果两种荧光信号都明显增强，则表明它是杂合子。另外分子信标（Molecular Beacon）就是专门为这种技术设计的探针。 

（2）基因表达的定量分析荧光定量PCR对各种基因的表达进行定量分析，如：同一基因在不同组织中的表达差异、同一基因在不同**处理后的表达差异、转基因食品的检测。过去*常用的高通量筛选基因表达差异的技术是cDNA芯片和差异显示，但这两种技术的缺点是只能定性而非完整意义上的定量分析。实时PCR技术和高通道实时 PCR 仪 的出现，无疑为这种检测提供了极大的方便。

（3）DNA甲基化检测荧光定量PCR可以进行DNA甲基化检测，DNA甲基化同人类的许多**有关，特别是癌症，Laird报道了一种称作Methylight的技术，在扩增之前先处理DNA，使得未甲基化的胞嘧啶变成尿嘧啶，而甲基化的胞嘧啶不受影响，用特异性的引物和Taqman探针来区分甲基化和非甲基化的DNA，这种方法不仅方便而且灵敏度更高。 

（4）单核苷酸多态性分析 荧光定量 PCR 可以进行单核苷酸多态性的分析，检测单核苷酸多态性对于研究个体对不同**的易感性或者个体对特定**的不同反应有着重要的意义，因分子信标结构的巧妙性，一旦SNP的序列信息是已知的，采用这种技术进行高通量的SNP检测将会变得简单而准确。

（5）定量定性分析传染性**荧光定量PCR对传染性**进行定量定性分析，这在我国应用比较广泛，大家比较熟悉。许多生产临床PCR试剂的厂商已经陆续推出了一系列的诊断试剂，如：肝炎系列、性病系列、肿瘤系列等等。

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