ChIP实验超声波破碎仪操作指南

ChIP实验超声波破碎仪操作指南

做ChIP**步就是去确定超声波破碎仪的参数设定，由于设备品牌不同，各项参数设置都需要自己摸索，十分不便。故此依据经验提出以下几点仅供参数，希望能给您带来帮助。

1.片段长度，如果是只做ChIP-PCR的话在200-1000范围内都可以，因为这个长度便于扩增，而ChIP-seq就得在200-500之间，这个范围便于测序。

2.超声能量，需要做几个梯度（如振幅10%-60%，或功率100W-400W），从小到大去测试，太小不能充分打断，太大则过度打断，甚至会过热、起泡。

3.超声时间，你需要做几个梯度（如1min-5min），这个是指超声总时间，不包括间隔。不要超声过久过度产热，会使你的蛋白变性或起泡，因为溶液里有表面活性剂SDS。

4.间隔时间，目的是让之前单次超声产生的热量冷却下来，10s-2min不等，一般不比单次超声时间短

5.注意事项：a建议*好体积不要太小，否则探头容易碰壁或离开液面，散热也不够好；b 整个超声过程*好在冰水混合浴中进行，道理如前； c用1.5ml的Ep管超声不易起泡。

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