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耐氨苄西林流感嗜血杆菌产β-内酰胺酶机制研究
耐氨苄西林流感嗜血杆菌产β-内酰胺酶机制研究
目的:探讨耐氨苄西林的流感嗜血杆菌产生β
-
内酰胺酶的机制。
方法
:对临床分离的
112
株流感嗜血杆菌耐药菌用纸片法作β
-
内酰胺酶测定,用
PCR
法检测产酶流感嗜血杆菌中的β
-
内酰胺酶基因的存在。结果:纸片法测得产酶菌株
32
株,产酶率
28.6
%
(32/112)
;
32
株产酶菌中
PCR
法测β
-
内酰胺酶基因阳性菌株
29
株,阳性率为
90.6%(29/32)
,其中质粒
DNA
模板组阳性为
25
株,基因组
DNA
模板组阳性为
4
例。结论:
(1)
流感嗜血杆菌耐氨苄西林主要由质粒介导产生β
-
内酰胺酶所造成。
(2)PCR
法是
研究
流感嗜血杆菌是否携带β
-
内酰胺酶基因及该基因所在位置的简便而有效的
方法
。
自
1972
年**次发现流感嗜血杆菌因产β
-
内酰胺酶而致耐氨苄西林以来[
1
],国外对耐氨苄西林流感嗜血杆菌的耐药机制以及产β
-
内酰胺酶的分子基础
研究
,
呈逐年增加趋势。
1978
年
Bryan
等[
2
]**报道了质粒介导产生β
-
内酰胺酶的流感嗜血杆菌。此后,围绕流感嗜血杆菌中的质粒编码β
-
内酰胺酶及其与耐氨苄西林的关系进行了许多研究。我国由于流感嗜血杆菌的分离率较低,对此
问题
的研究一直没有深入。本文作者在本实验室成功提高流感嗜血杆菌分离率的基础上[
3,4
],分离获得
36
株耐氨苄西林的流感嗜血杆菌,用纸片法测定它们产β
-
内酰胺酶的情况后,用
PCR
方法对产酶菌中β
-
内酰胺酶基因的存在与否进行了检测,对耐氨苄西林的流感嗜血杆菌产生β
-
内酰胺酶机制作了初步
分析
。
1
材料和方法
1.1
流感嗜血杆菌的分离培养 收集痰或咽拭子标本,于
1 h
内接种于改良的哥伦比亚巧克力琼脂平板中,置
5% CO2
孵箱,
37
℃孵育
18
~
24 h,
对疑似流感嗜血杆菌的菌落分别于血琼脂和营养琼脂平板上作卫星试验,仅在血琼脂平板上卫星试验阳性者为流感嗜血杆菌。用常规的纸片法(
K-B
法)对每个菌株作体外**敏感试验,根据美国
NCCLS
标准判读药敏结果。从平板上挑取耐氨苄西林的单菌落接种于含
3 ml
液体
HTM
培养液的试管中,于
5% CO2
孵箱
37
℃孵育培养过夜,离心收集菌体用于质粒制备等后续实验。
1.2
纸片法测定β
-
内酰胺酶 将流感嗜血杆菌培养物经超声裂解后直接涂布于β
-
内酰胺酶纸片上,在
15 min
内变红者为阳性。
超声仪为
Branson Sonifier 250
,β
-
内酰胺酶纸片购自
Oxid
公司。
1.3
PCR
法检测β
-
内酰胺酶基因
1.3.1
PCR
引物 针对β
-
内酰胺酶结构基因的
PCR
引物由本校分子遗传学开放实验室用
PCGENE
软件
PCRPLAN
程序设计,上海生工生物工程公司协助合成。引物序列为:上游引物:
5
′
TGGGTGCACGAGTGGGTTAC3
′,下游引物:
5
′
TTATCCGCCTCCATCCAGTC3
′。
1.3.2
PCR
反应条件 用
PE2400
型
DNA
扩增仪
,50
μ
l PCR
反应体系中含有模板
DNA 1
μ
l
、上游下游引物各
1
μ
l
(浓度为
25
μ
mol/L
),
10
×缓冲液
5
μ
l
,
dNTP
混合物(
10 mmol/L
)
4
μ
l
,并用
ddH2O
补足至
50
μ
l
(
Mg2+
的终浓度为
1.5 mmol/L
),以
94
℃
3 min
→
(94
℃
1 min
→
55
℃
1 min
→
72
℃
1 min
,循环
30
次
)
→
72
℃
7 min
→
4
℃保温。
PCR
反应后取
10
μ
l
产物点样,进行琼脂糖凝胶电泳并拍照。
1.3.3
PCR
模板的制备 **质粒
DNA
用常规碱裂解法分离、
RNase
Ⅰ消化、酚
/
氯仿抽提纯化[
3
];**基因组
DNA
用菌体冻融法制备:取少量**于
1.5 ml
塑料离心管中,用蒸馏水重悬,加入少量溶菌酶于
37
℃水浴
5 min
,放入液氮迅速冰冻
5 min
,取出后立即放入
37
℃水箱融化
5 min
,重复冻融
3
次,室温下
1
×
104 r/min
离心
5 min
,吸取上清液到新的离心管,加入
1.5
倍 体积的无水乙醇于
-20
℃沉淀
30 min
,
1.5
×
104 r/min
离心沉淀,用
10
μ
l TE
溶解后备用。
2
结 果
2.1
流感嗜血杆菌的分离 自
1997
年
10
月至
1998
年
11
月
,
从我院呼吸内科及耳鼻咽喉科呼吸道感染患者中收集
634
份痰及咽拭子标本,分离鉴定出
112
株流感嗜血杆菌
,
其中,药敏试验证明为氨苄西林耐药的
36
株。
2.2
β
-
内酰胺酶检测结果
36
株耐氨苄西林流感嗜血杆菌中,纸片法测得产酶菌株
32
株,耐药菌中产酶率
88.9%(32/36)
。
2.3
PCR
法检测β
-
内酰胺酶基因结果 用针对β
-
内酰胺酶基因的上游和下游特异性引物扩增后,阳性条带大小为
486 bp
,扩增结果与预期值相同。
32
株产酶菌中
PCR
阳性菌株
29
株,阳性率为
90.6%
。其中以质粒为模板
PCR
阳性菌株
25
株,占产酶菌的
78.1%
(
25/32)
;对
7
株质粒
DNA
模板
PCR
阴性的菌株,以基因组
DNA
为模板进行
PCR
扩增,结果有
4
株为阳性。
3
讨 论
国外对耐氨苄西林流感嗜血杆菌产β
-
内酰胺酶的分子机制研究,主要采用的方法是在大量培养**的基础上,通过
CsCl
密度梯度超离心等方法获取较大量的质粒
DNA
,进行限制性内切酶酶切
分析
、琼脂糖凝胶电泳、质粒转化试验等,大致分析质粒
DNA
的大小、结构,验证质粒介导的耐氨苄西林表型等,获得质粒介导的产酶及其与耐氨苄西林**的关系等的可靠证据[
6
]。但是,
自然
状态的流感嗜血杆菌菌株中所携带的野生型质粒的大小、结构、拷贝数差异非常大,对**培养的数量、质粒抽提纯化的方法提出了很高的要求,其结构的变异也造成电泳、酶切分析等方法难以做到**分析质粒的结构。另外,野生型质粒的分子量通常较大,常用的转化实验成功率不高;再加上野生型菌株中所含质粒结构复杂,而这些方法都未能直接鉴定质粒
DNA
中是否携带有编码β
-
内酰胺酶的基因。
鉴于上述情况,本实验设计了针对β
-
内酰胺酶基因的特异性引物,对所分离获得的产β
-
内酰胺酶的耐氨苄西林流感嗜血杆菌中该酶编码基因的存在情况进行了直接的
PCR
检测。结果发现,
32
株产β
-
内酰胺酶的流感嗜血杆菌,用可靠的碱变性法获取的质粒
DNA
为模板进行
PCR
检测,阳性率达到
78.1%
,而
7
株质粒
DNA
模板
PCR
阴性的产酶菌株中,有
4
株在以染色体
DNA
样品为模板进行的
PCR
反应中表现阳性。这些结果提示耐氨苄西林的流感嗜血杆菌编码β
-
内酰胺酶的基因主要存在于所携带的质粒
DNA
上,而有少部分酶基因位于染色体
DNA
上,这与
文献
报道的结论一致。从方法上看,本研究所采用的
PCR
法直接检测耐氨苄西林流感嗜血杆菌中β
-
内酰胺酶基因的方法,特异性高,标本产β
-
内酰胺酶的核苷酸序列具有高度的特异性;敏感性高,
PCR
方法可将待测
DNA
片断的量扩大百万倍,可以检测**含量极微的标本;既可以测质粒模板β
-
内酰胺酶基因,也可以测染色体模板β
-
内酰胺酶基因;如果配合
PCR
产物的序列测定等,还可用于β
-
内酰胺酶分类、基因序列分析、分子流行病学调查等。但
PCR
方法有假阳性的情况,如β
-
内酰胺酶基因结构出现变异但未
影响
PCR
引物结合位点时,可能存在
PCR
阳性但基因并无活性的情况。从
理论
上讲,能产生β
-
内酰胺酶的菌株均应有相应的编码基因存在,但本实验中有
3
株
PCR
阴性,可能的原因是模板制备过程以及
PCR
反应过程所造成的假阴性所致。虽然国外有用
PCR
方法检测流感嗜血杆菌菌株、β
-
内酰胺酶基因及其分类的报道[
7
],国内袁艺等[
8
]曾用
PCR
法检测流感嗜血杆菌菌株,但对产β
-
内酰胺酶的耐氨苄西林流感���血杆菌,分别以其质粒
DNA
和染色体
DNA
为模板,用
PCR
方法测β
-
内酰胺酶基因,研究其产酶和耐药机制的,国内外均未见报道。
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