近年来，个人基因组的蓬勃发展的确让研究人员领略到新一代测序的威力，通量高，速度快，然而新一代测序仪的昂贵价格也让普通实验室不敢问津。介于此，Illumina公司推出了经济型的Genome AnalyzerIIe测序系统。此系统利用Genome AnalyzerIIx的结构和久经考验的边合成边测序试剂，每次运行能产生大约20 Gb的数据（刚上市时），而价格约为Genome AnalyzerIIx的一半。随着Illumina将Genome AnalyzerIIx的通量提高到95 Gb，Genome AnalyzerIIe的产量也有望达到40 Gb。
如此具有竞争力的价格，再加上系统的通量和易用性，相信对小型实验室非常有吸引力。那些不需要超高产量的研究人员现在有了一条经济的途径，通向新一代测序的广大应用。GenomeAnalyzerIIe提供了无以伦比的性能、可扩展性和简单的流程，让Illumina的测序技术成为世界上*值得信赖且*广泛采用的平台。Illumina提供了完整的软件方案，并与众多第三方供应商合作，协助简化数据分析，让研究人员更快更轻松地发现有意义的结果。
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图1：Genome AnalyzerIIe系统
经过验证的技术
有了无以伦比的性能、扩展性和简单的流程；GenomeAnalyzerIIe已经成为*值得信赖且*广泛采用的新一代测序平台。由Illumina经过验证的边合成边测序技术推动，GenomeAnalyzerIIe变革了测序研究，实现了*广泛的应用，并催生了无数的科学突破和数百篇开创性的论文。
通过Genome AnalyzerIIx的低价版本GenomeAnalyzerIIe，这个行业标准的新一代测序技术现在可被任何规模的实验室所接受。对于不需要超高通量的精打细算的研究人员而言，GenomeAnalyzerIIe提供了通向新一代测序的经济之路，同时不牺牲Illumina测序的性能准确性、读长或流程简便性。
GenomeAnalyzerIIe非常适合许多低至中产量的应用，包括新物种测序，小至中等大小基因组的重测序，RNA和小RNA测序，ChIP-Seq及宏基因组研究。
流线型的新一代流程
GenomeAnalyzerIIe测序流程基于三个简单的步骤。在6小时内，用标准化的即用型试剂盒从几乎所有核酸样品中制备文库。利用全自动的无乳滴PCR的cBot簇生成系统，克隆扩增在4小时内完成，而手工操作时间不到10分钟。利用标准的测序试剂，大规模并行合成测序在流动槽内进行。流动槽的每条道能在单个测序运行中处理多个样品，降低每个样品的整体费用。
简化的数据分析
GenomeAnalyzerIIe中包含的分析软件和硬件促成了端对端的测序方法，让研究人员能够从原始的数据获取迅速前进到具生物学意义的可发表结果。Illumina的测序控制软件（SCS）提供了实时的分析处理，能直接在仪器计算机上自动产生图像强度和质量打分的碱基判定。利用Pipeline分析软件可将这些读取与参考序列比对并分析。再加上ConsensusAssessment of Sequence and Variation（CASAVA）软件，GenomeStudio?数据分析软件提供了直观的图像分析以及DNA和RNA数据的相互作用。
Illumina还与多个第三方供应商合作，他们提供了简化并扩展测序数据分析的有力工具，让研究人员能更快更轻松地发现结果。
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GenomeAnalyzerIIe通过广泛的应用、无以伦比的性能以及适合您研究的价格，实现了无限的探索。
单读和对读，短片段和长片段
GenomeAnalyzerIIe支持单读及对读文库测序。短片段及长片段对读测序的组合，伴随着2×100个碱基的读长，大大扩展了现有的应用范围。GenomeAnalyzerIIe需要标准的Illumina对读模块，进行自动的试剂输送和**向读取测序。
低起始量要求
系统所需的样品起始量低至100 ng，实现了样品受限的大量应用（比如**沉淀物、激光切割材料和小的模式系统）。
经过验证的测序试剂
基于新颖的可逆荧光标记终止子，Illumina的边合成边测序技术实现了单碱基掺入增长的DNA链事件的检测。在每个测序循环中，由于四个可逆终止子dNTP都存在，自然的竞争让掺入偏向*小化。同聚物没有任何问题，因为每个循环每次只拷问每个模板的一个碱基。可逆终止子试剂确保了严格的逐个碱基测序。
Genome AnalyzerIIe的优势：
? 经过验证的技术，任何实验室可接受
以经济的价格使用*广泛采用的新一代测序技术
? 流线型的流程
以目前*简单*自动化的流程处理样品
? 简化的数据分析
通过Illumina和第三方供应商的一系列产品进行简化的数据分析，更快更轻松地获得结果