Sigma-Aldrich公司近日在全球推出MISSION? esiRNA,一种基因特异的siRNA库,它为哺乳动物细胞中的RNAi筛选提供了一种强有力的方法。与传统的合成siRNA不同,esiRNA集合了数百个针对单个基因靶点的siRNA。这种新工具能避免鉴定有效siRNA的反复试验过程,迅速实现基因沉默,并确保脱靶效应*低。
此项技术与传统的单个siRNA介导的基因knockdown相比,优势相当明显。以前,我们需要反复试验,来鉴定出*有效的siRNA,现在有了这个siRNA的“超级库”,这一步都省了。此外,esiRNA还能确保*低的脱靶效应。esiRNA是由德国马普学会细胞生物学和遗传学(MPI-CBG)开发的。
MPI-CBG的课题组组长FrankBuchholz开创了esiRNA技术在RNAi筛选中的应用。他表示:“我们很高兴能与Sigma-Aldrich合作,让整个学术界都能享有esiRNA技术。10年前,esiRNA在美国旧金山加州大学的MikeBishop实验室中发明。自此,它就成为我的研究重点。Sigma-Aldrich在RNAi方面的丰富经验和产品线是我们生产高效特异esiRNA的**补充。”
哈佛大学医学院正在运用esiRNA来协助鉴定促使HIV增殖的人类基因。临床研究员AbrahamBrass博士认为MISSIONesiRNA的初步试验结果表明多个基因都能被非常有效地knockdown。哈佛医学院很快将会把此项技术整合到多项研究中。
esiRNA是由核酸内切酶制备的(下图)。首先用特异的引物扩增*佳的靶区域。序列经过验证后,利用RNA聚合酶产生300-600bp基因特异的双链RNA,随后用核酸内切酶切割产生短的dsRNA。这些类似siRNA的分子经过纯化,就形成了siRNA库,它们靶定了单个基因的不同序列。
MISSION esiRNA具有下列优势:
目前,MISSIONesiRNA有以下几种规格,满足不同实验的需求:
MISSION esiRNA的相关文献:
Theis, M. et al.Comparative profiling identifies C13orf3 as a component of the Skacomplex required for mammalian cell division. EMBO J. Apr23 (2009). [Epub ahead of print] Abstract
Kittler, R. et al.Genome-scale RNAi profiling of cell division in human tissueculture cells. Nat. Cell Biol. 9, 1401-12(2007). Abstract