MeDIP/ChIP-chip技术服务
代做实验，MeDIP/ChIP-chip，实验外包
技术服务详细描述
MeDIP/ChIP-chip的出现超越了以往传统的芯片分析方法。传统的芯片检测方法只能对基因调控做管中窥豹式的研究，然而事实上转录是一个非常复杂的过程，它涉及到多种形式的相互作用以及大量组分间的精妙的互相结合。MeDIP/ChIP-chip技术能为一些重要机制的研究提供线索，包括DNA复制、修饰、修复，更重要的还有甲基化以及组蛋白修饰等等；还能帮助我们更好的理解一些**的发生机理比如糖尿病、白血病、乳腺癌等。除此之外，MeDIP/ChIP-chip技术也已在一些至关重要的生命过程中为我们提供了重要的线索，包括细胞增殖、细胞分化、癌症发生、细胞周期、细胞凋亡以及神经生成等过程。
1、研究基因启动子部位组蛋白的甲基化乙酰化或磷酸化水平改变
2、研究所以基因启动子部位DNA甲基化水平改变
3、研究转录因子与其结合的所有基因启动子DNA结合水平改变
康成生物为您提供MeDIP/ChIP-chip技术服务，您只需要提供保存完好的组织或细胞标本，康成的芯片技术服务人员就可为您完成全部实验操作，包括超声打断基因组、**共沉淀、线性扩增、荧光标记、芯片杂交、图像采集和数据分析、并提供完整的实验报告。根据您的需要您可选择不同厂家提供的甲基化芯片，包括Agilent和NimbleGen。
Agilent MeDIP-chip(DNA甲基化芯片)
通过SurePrint 芯片合成**技术、优化探针设计、及实验方法，Agilent 的甲基化芯片可灵活进行甲基化研究，得到高灵敏度、高特异性、高重复性的结果。
| 产品名称 | 芯片格式 | 探针解析度 | 描述 |
| Human CpG Islands | 244K x 1 | 195K 探针在CpG岛内，50K探针在CpG岛间
探针平均间距95bp | 数据来源UCSC hg17(NCBI Build35)
覆盖约27800 个CpG岛 |
| Mouse CpG Islands | 2 x 105K | 97652个CpG岛探针
探针平均间距95bp | 数据来源UCSC mm8(NCBI Build36)
覆盖16030个CpG岛 |
| Human Promoter | 244K x 2 | 探针覆盖转录起始位点上游5.5kb至下游2.5kb
平均每基因探针数25个
探针平均间距195bp | 数据来源UCSC hg17(NCBI Build35)
覆盖约17000个RefSeq数据库中已研究清楚人转录本的启动子 |
| Mouse Promoter | 244K x 2 | 探针覆盖转录起始位点上游5.5kb至下游2.5kb
平均每基因探针数25个
探针平均间距200bp | 数据来源UCSC mm7(NCBI Build35)
覆盖约17000个RefSeq数据库中已研究清楚小鼠转录本的启动子 |
| Human Proximal Promoter | 4x44K | 探针覆盖转录起始位点上游1kb至下游0.3kb
平均每基因探针数3个
探针平均间距500bp | 数据来源UCSC hg17(NCBI Build35)
覆盖约17917个RefSeq数据库中已研究清楚人的转录本的启动子 |
NimbleGen MeDIP-chip(DNA甲基化芯片)
NimbleGen含CpG岛和启动子的芯片系列—单芯片设计覆盖所有UCSC注释的CpG岛和所有RefSeq数据库基因的启动子区。
| 产品名 | 物种 | 基因组版本 | CpG 岛数 | 启动子上游Tiling (bp) | 启动子下游 Tiling (bp) |
| 2006-11-02 HG18 CpG Promoter | Homo sapiens | HG18 | 28226 | 800 | 200 |
| 2007-02-27 MM8 CpG Promoter | Mus musculus | MM8 | 1596, 3&, lt;, o:p> | 1300 | 500 |
另外还有探针根据RefSeq数据库设计的芯片，包括RefSeq数据库中所有已被研究清楚的基因（带NM前缀的RefSeq基因）。人类（2.8Kb）、小鼠（2.6Kb）及大鼠（2.8kb）的启动子区被覆盖，启动子覆盖区平均探针间隔为100bp。
| 探针设计名 | 启动子上游Tiling(bp) | 启动子下游Tiling(bp) |
| HG18 RefSeq promoter | 2200 | 500 |
| MM8 RefSeq promoter | 2000 | 500 |
| RN34 RefSeq promoter | 2250 | 500 |
Agilent ChIP-on-chip 芯片
| Agilent | 芯片格式 | 探针解析度 | 描述 |
| Human Promoter | 244K x 2 | 探针覆盖转录起始位点上游5.5kb至下游2.5kb
平均每基因探针数25个
探针平均间距195bp | 数据来源UCSC hg17(NCBI Build35)
覆盖约17000个RefSeq数据库中已研究清楚人转录本的启动子 |
| Mouse Promoter | 244K x 2 | 探针覆盖转录起始位点上游5.5kb至下游2.5kb
平均每基因探针数25个
探针平均间距200bp | 数据来源UCSC mm7(NCBI Build35)
覆盖约17000个RefSeq数据库中已研究清楚小鼠转录本的启动子 |
NimbleGen人、小鼠、大鼠ChIP-on-chip芯片
芯片探针根据RefSeq数据库设计，包括RefSeq数据库中所有已被研究清楚的基因（带NM前缀的RefSeq基因）。人类（2.8Kb）及小鼠（2.6Kb）的启动子区被覆盖，启动子覆盖区平均探针间隔为100bp。
| 产品目录号 | 探针设计名 | 启动子上游Tiling(bp) | 启动子下游Tiling(bp) |
| C4226-00-01 | HG18 RefSeq promoter | 2200 | 500 |
| C4222-00-01 | MM8 RefSeq promoter | 2000 | 500 |
| C4495001-00-01 | RN34 RefSeq promoter | 2250 | 500 |
上海拜沃生物科技有限公司
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