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中科院院士*新Nature Genetics文章解析癌症易感基因

来自解放军**医学科学院,南京医科大学,中国医学科学院肿瘤研究所,复旦大学,中山大学肿瘤医院等处的研究人员在人类染色体的特殊位置发现了一个容易导致肝癌的易感基因区域。这一重大发现不但有助于科学家们深入解析肝癌的发病机制,而且为肝癌的风险预测、早期预防和个体化**以及新型高效**的筛选提供了理论依据和生物靶标。这一研究成果公布在《NatureGenetics》杂志上。

领导这一研究的是解放军**医学科学院院长、中国科学院贺福初院士,主要从事基因组学、蛋白质组学与生物信息学研究。曾发现“细胞活性因子的发育相关进化”、“相互作用分子的协同进化”、“mRNA编码区与非编码区的协调进化”及“物种演化中的分子减速进化”等规律性现象。

 

 

肝癌仍是目前临床上**效果*不理想的肿瘤之一。中国是肝癌高发国家,每年新发病例30万,占全球肝癌新发病例的半数以上。

为找到并确认容易导致肝癌的遗传易感基因,在这篇文章中,研究人员在国内5个肝癌高发区收集了4500多名肝癌病例和对照个体,运用全基因组关联分析方法,在全基因组范围内进行了系统的筛选和实验验证。经过潜心研究,他们在人体第1号染色体的一个特殊位置发现了一个由多个基因组成的区域,这个区域是容易导致肝癌的“罪魁祸首”。

这一重大发现不但有助于科学家们深入解析肝癌的发病机制,而且为肝癌的风险预测、早期预防和个体化**以及新型高效**的筛选提供了理论依据和生物靶标。

这项研究是国际上**基于大规模人群和全基因组水平的肝癌易感基因的筛查研究,所使用的全基因组关联研究技术是目前全球科学界公认的行之有效的拉网式搜寻重大**易感基因的研究方法。此前,欧美多国利用该技术已经发现了近70种重大**的易感基因。

去年贺福初院士、张令强研究员实验室还发现了一个人种中特有的、特异性负调控抑癌基因“p53”功能的新型蛋白质。这种被命名为Apak(ATM与p53结合的KZNF家族蛋白)的蛋白可以选择性地干扰p53这一至关重要的抑癌基因所介导的细胞凋亡效应,从而可能成为肿瘤防治的新型靶向分子。这一研究成果发表NatureCell Biology上。

研究人员在前期人胎肝新基因、新蛋白大规模发掘的基础上,通过历时近六年的潜心探索,发现Apak蛋白参与p53的选择性调控,当Apak与p53结合在一起时,p53就无法引发细胞凋亡,但对于细胞周期与细胞分裂等过程没有显著影响。当细胞遇到基因组损伤信号时,Apak与p53解离,从而释放p53的杀伤细胞功能,以便及时**掉对机体带来危害的部分“变坏”的细胞。形象地说,Apak就像p53这把“利剑”的“鞘”。

蛋白质组学国家重点实验室长期致力于包括肝癌在内的多种肝病的易感基因及其致病机理的研究,过去10年间已经在乙型肝炎病毒感染的慢性化和重症化等关键环节找到了易感基因。这次发表于《自然遗传学》的论文是该团队近两年发表的第11篇《自然》子刊论文,是肝病易感基因领域的又一重大原创性成果,进一步巩固了他们在此领域的国际**地位。

原文摘要:

Genome-wide association study identifies 1p36.22 as a newsusceptibility locus for hepatocellular carcinoma in chronichepatitis B virus carriers
To identify susceptibility variants for hepatitis B virus(HBV)-related hepatocellular carcinoma (HCC), we conducted agenome-wide association study by genotyping 440,794 SNPs in 355chronic HBV carriers with HCC and 360 chronic HBV carriers withoutHCC, all of Chinese ancestry. We identified one intronic SNP(rs17401966) in KIF1B on chromosome 1p36.22 that was highlyassociated with HBV-related HCC and confirmed this association infive additional independent samples, consisting of 1,962individuals with HCC, 1,430 control subjects and 159 family trios.Across the six studies, the association with rs17401966 was highlystatistically significant (joint odds ratio = 0.61, P = 1.7 ×10?18). In addition to KIF1B, the association region tagged twoother plausible causative genes, UBE4B and PGD. Our findingsprovide evidence that the 1p36.22 locus confers susceptibility toHBV-related HCC, and suggest that KIF1B-, UBE4B- or PGD-relatedpathways might be involved in the pathogenesis of this malignancy.