Genome-wide association study identifies three newsusceptibility loci for esophageal squamous-cell carcinoma inChinese populations
来自中国医学院/北京协和医学院,南京医科大学,北京大学等处的研究人员通过全基因组关联研究技术发现了三个全新的中国人群食管鳞状细胞癌(Esophagealsquamous cell carcinoma ,ESCC)易感位点,这对于解析这一**的分子机理,以及相关**具有重要意义。
领导这一研究的是中国医学科学院北京协和医学院肿瘤医院肿瘤研究所病因及癌变研究室主任林东昕教授,他曾于1998年获得国家杰出青年科学基金,2003-2004年度被评为卫生部有突出贡献中青年专家、国务院颁发政府特殊津贴专家。林教授研究组曾较系统地研究了致癌物代谢、DNA修复、细胞周期和凋亡控制、肿瘤**等系统的基因遗传变异与肺癌、食管癌、胃癌、乳腺癌、结-直肠癌等常见肿瘤发生和发展的关系。
Arabidopsis REF6 is a histone H3 lysine 27 demethylase
来自中科院遗传与发育生物学研究所的研究人员与德国的科学家一道获得了组蛋白H3K27me3去甲基化酶研究方面的重要进展。
PcG介导的组蛋白H3第27位赖氨酸上**基化(H3K27me3)在基因沉默和发育调控中起着至关重要的作用。小鼠胚胎干细胞中超过10%的基因受该种修饰调控,拟南芥中超过7,000个基因受该修饰调控。拟南芥中H3K27me3主要由CLF和SWN两个甲基转移酶催化,并招募LHP1结合以有效抑制基因表达。在哺乳动物中H3K27me3修饰是可逆的,但植物中并不存在哺乳动物中H3K27me3去甲基化酶KDM6的直系同源物。此前有研究表明,拟南芥中H3K27me3甲基化也是可以被主动去除的,因此揭示H3K27me3去甲基化的分子机制是植物表观遗传学研究中的一个重要科学问题。
在这篇文章中,研究人员对植物组蛋白去甲基化酶基因家族进行了系统鉴定和功能分析。该研究组首先建立了植物细胞内组蛋白去甲基化酶活性检测体系,通过该体系发现拟南芥REF6/JMJ12可以特异性地去除H3K27双甲基化和**基化修饰。过表达REF6的植物与H3K27me3功能异常突变体具有相似的表型。
并通过遗传学研究证明,clfswn对ref6表现上位效应,同时ref6可以部分回复clf的表型,表明REF6和H3K27me3甲基转移酶起着相互拮抗的作用。通过H3K27me3抗体进行染色质**共沉淀结合大规模测序分析鉴定了数百个基因H3K27me3水平上升,这些基因多数是REF6的靶基因,参与植物发育以及对各种刺激响应等多种生物学过程。转录组分析表明,这些基因上H3K27me3水平上升与其转录抑制呈正相关。
这一研究工作填补了植物H3K27me3调控机制的一个重要空白,并表明该机制在高等动植物中是保守的,为进一步研究H3K27me3在植物生长发育及对环境响应过程中的作用奠定了基础。