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载体构建|实验技术服务
关键词:载体构建|实验技术服务
简介:世界**品牌载体构建|实验技术服务原装**,质量保证,价格优惠。
载体构建|实验技术服务——pCzn1质粒+Arctic Express宿主菌低温表达体系。
我们具备丰富的蛋白表达设计经验及实验操作技巧,承诺客户不成功不收费。我们所有的实验数据真实可信,我们提供原始的表达菌株和克隆质粒,客户可以依据我们的实验报告重复我们的实验结果。
产品品牌:载体构建|实验技术服务 http://www***********.com/goodsid/fenleiyi/2868603/1.html
测序实验流程:
设计siRNA靶序列
在制备siRNA 前都需要单独设计siRNA序列.研究发现对哺乳动物细胞,*有效的siRNAs是21-23个碱基大小、3’端有两个突出碱基的双链RNA;而对非哺乳动物,比较有效的是长片段dsRNA。siRNA的序列专一性要求非常严谨,与靶mRNA之间一个碱基错配都会显著削弱基因沉默的效果。
1. 选择siRNA靶位点
从转录AUG起始密码子开始,搜寻下游AA序列,记录跟每个AA 3’端相邻的19个核苷酸作为候选的siRNA靶位点。有研究结果显示GC含量在30%-50%左右的siRNA要比那些GC含量偏高的更为有效。Tuschl等建议在设计siRNA时不要针对5'和3'端的非编码区(untranslated regions,UTRs),原因是这些地方有丰富的调控蛋白结合区域,而这些UTR结合蛋白或者翻译起始复合物可能会影响siRNP核酸内切酶复合物结合mRNA从而影响siRNA的效果
2. 序列同源性分析
将潜在的序列和相应的基因组数据库(人或者小鼠、大鼠等等)进行比较,排除那些和其他编码序列/EST同源的序列。例如使用BLAST( www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST/)选出合适的目标序列进行合成.并非所有符合条件的siRNA都一样有效,其原因还不清楚,可能是位置效应的结果,因此对于一个目的基因,一般要选择3-5个靶位点来设计siRNA。
3. 设计阴性对照
一个完整的siRNA实验应该有阴性对照,作为阴性对照的siRNA应该和选中的siRNA序列有相同的组成,但是和mRNA没有明显的同源性。通常的做法是将选中的siRNA中的碱基序列打乱。当然,同样要保证它和其他基因没有同源性。
合成模板
1. 合成编码 shRNA的DNA 模板的两条单链,模板链后面接有RNA PolyIII聚合酶转录中止位点,同时两端分别设计 BamH I 和 Hind III 酶切位点,可以克隆到 siRNA 载体多克隆位点的 BamH I 和 Hind III 酶切位点之间。
2. 95℃,5 min,缓慢退火, DNA 单链得到 shRNA 的 DNA 双链模板。
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