其离心管是垂直放置,样品颗粒的沉降距离短,离心所需时间也短,适合用于密度梯度区带离心,离心结束后液面和样品区带要作九十度转向,因而降速要慢。
主要用于样品在短时间作密度梯度离心。甩平转子分离粒子位移距离长,分辨能力高,分离后组分的区带较宽,便于回收,但所需时间长,垂直转子分离的粒子位移距离等于离心管直径。转子转动前,管内密度梯度溶液的密度是沿重力方向变化,转动后,溶液的密度逐渐改变为离心力方向(水平方向)变化,离心结束后,溶液的密度变化方向因重力作用又沿铅垂方向变化,形成铅垂方向的密度梯度,由于离心管是垂直放置,所以溶液粒子位移的距离等于离心管的直径。离心时间短,离心后样品组分的区带较宽,但因离心时间短,粒子得不到充分分离,将会失去一些组分,又因区带与梯度介质的接触面大,易于扩散,停机后密度重新定向,易于混合,所以作区带离心的效果,垂直转子不如甩平转子。