抗原抗体反应重要的特点是具有高度的特异性，而抗原的特异性又是以它本身的分子结构为基础的。
实验表明，抗原与抗体的特异性结合与抗原分子表面的特殊结构的化学基团有关，称这种能与抗体特异性结合的，抗原分子表面的特殊结构的化学基团，为抗原决定簇（determinant）。
抗原决定簇与相应的淋ba 细胞表面的抗原受体（mIg或TCR）结合，诱导机体产生免yi 应答；抗原决定簇与相应的抗体特异性结合发生免yi 反应。因此，抗原决定簇是免yi 应答和免yi 反应具有特异性的物质基础，即抗原决定簇决定了抗原的特异性。抗原决定簇的化学基团（对位上的酸基不同）性质不同，其抗原特异性就会有差别。抗原决定簇的空间构型（羧基的邻位、间位和对位）也影响抗原的特异性。由此可以证明，天然蛋白质的抗原决定簇，由于其氨基酸的数目、组成、排列顺序、空间构型的差异，从而引起了抗原特异性的不同。