所谓细胞系鉴定即通过 STR（短串联重复）图谱所建立细胞系的遗传特征。一株细胞系的遗传特征确立后，细胞系可以通过定期的检测，以防止出现细胞系被误认或交叉污染的情况。
首先进行细胞系STR鉴定是很重要的。很多生物医药的研究都采用培养细胞来进行，这些细胞可能是受赠于其它研究人员,也可能是从细胞库(如美国 ATCC,American Type Culture Collection)得来。据估计，15-20%的实验室，实验中所使用的细胞已经不是原来的细胞系，或者与其它细胞系发生了交叉污染。显然，细胞系遭到污染、特征鉴别错误，将会大大的威胁着基于这些细胞而发表的论文质量和研究发现的正确性。为此，很多细胞库现在都要对提交来的细胞系进行鉴定，并对细胞系之间的交叉污染进行监测。
现在很多机构都已经认识到这个的重要性，ATCC和FDA，这些机构要求对用于制药领域的实验中所使用的材料 — 诸如细胞系 — 应该进行“身份鉴定”和纯度测试。很多杂志也要求使用细胞系的文章提供STR指纹图谱数据。
FDA建议研究人员在培养细胞的较早阶段(细胞培养第1周)来鉴定细胞系的身份。细胞在被冻存前应再一次进行鉴定；对于活跃生长的细胞，每两个月应鉴定一次；文献发表前也应对细胞系身份进行鉴定。
如果一个实验室使用不止一种细胞系，则应在实验 zui 开始时，就要对所有的细胞系进行鉴定，以便排除交叉污染。
这样将减少由于细胞系发生交叉污染或身份误认，将导致实验数据的无效或数据误导。