实验流程:
从细胞材料中提取 RNA→RNA 加入到含有逆转录酶、引物、dNTPs 的反应体系中→退火,引物与 RNA 链配对→延伸,逆转录酶合成互补 cDNA 链变性→常规 PCR 反应流程(变性、退火、延伸,如此多次循环)。
RT-PCR“两步法"与“一步法":
RT-PCR 的实验操作分为“一步法"与“两步法"两种。一步法 RT-PCR 能克隆微量 mRNA 而不需构建 cDNA 文库(即 cDNA 合成与 PCR 反应在同一 Buffer 及酶中进行,一步法完成),省略了 cDNA 与 PCR 之间的过程。两步法 RT-PCR 首先用反转录酶合成 cDNA,然后以 cDNA 为模板进行 PCR,即 RNA 反转录与 PCR 扩增分两步进行。一步法 RT-PCR 与两步法相比快速、简便、减少了污染机会、减少了 RNA 二级结构、减少了 PCR 反应的错配率。RT-PCR 两步法的优势在于存在中间产物 cDNA,便于保存;且第2步 PCR 只取逆转录反应产物的 1/10 进行反应,有利于 PCR 条件的调整,实验重现性强;两步法可以在第2步 PCR 反应体系中加入特异性引物,其灵敏度比一步法高;两步法的实验预算要低于一步法。但是由于两步法包括第1链 cDNA 合成和随后的 PCR 反应,容易产生污染问题。
实验操作注意事项:
1、RNA 提取一定要迅速,样本要新鲜,组织尽量在液氮中研磨;
2、 RNA 提取完马上进行逆转录不要拖延,新提的 RNA 很容易降解;
3、逆转录反应过程,需建立无 RNAase 环境,以避免模板 RNA 降解;
注:
RNase 是 RNA 水解酶的统称,包含 RNase A,RNase H 等,RNase A 可以水解单双链 RNA,RNase H 主要水解 RNA 与 DNA 杂交双链中的 RNA。