畜牧业长期面临着与粪便和工艺用水管理方面的挑战。农业产业一直专注于气味控制和保护环境质量多年，但温室气体排放和气候变化农业的认识的贡献起到了推波助澜的新发展，遏制甲烷的排放。环境保护署（EPA）估计，仅在美国，畜禽粪便排放量约200万吨的甲烷，约占8％的年度人为甲烷排放量在美国。为遏制温室气体的排放，许多国家，地区，州和地方政府在美国，南美，中国和欧洲已经制定规章和激励机制，促进沼气设施的发展。
厌氧消化和沼气回收系统提供除了多种好处气味控制，甲烷回收和生产有用的能量。稳定的出水增强了价值超过化肥原料肥由于营养物质的供应量增加，特别是氮。生产的固体具有价值，土壤改良剂，盆栽土或堆肥。
沼气回收系统包括厌氧消化和沼气收集系统。它也可以包括一个燃烧系统燃烧现场沼气产生热，电或热水。在沼气甲烷含量的范围可以从50％到80％，使得沼气一个清洁燃烧燃料。对于大多数畜牧生产者，在现场使用沼气等抵消能源使用，降低运营成本。其他较大规模生产所销售的能量，或者通过连接到一个天然气网格，或通过发电连接到电网。