DNA合成仪的操作步骤
DNA合成仪的操作步骤
以亚磷酰胺寡核苷酸的合成为例,介绍该类仪器的一般操作步骤。亚磷酰胺DNA合成试剂包括:5/-DMT保护碱基,A、G、C、T的亚磷酰胺单体,四唑偶联催化剂,醋 酸 酐,N-甲基咪唑封闭剂,三***(TCA)脱保护液,12氧化混合物、乙腈清洗溶剂、除氨溶液。使用步骤如下:
1)仔细检查合成仪上所有试剂瓶的试剂量,必要时更换试剂瓶,特别注意乙腈的量,因为溶剂量比较大。
2) 将标记好的干净收集瓶放在合成器上。
3) 将要合成的DNA序列输入合成仪。
4) 检查选择的合成步骤是否正确。
5) 选择结束方式:TritylOffAuto 为仪器的原始状态。如果您打算将纯化的寡核苷酸与 5-DMT 基团连接,请将其更改为 TritylOnAuto 的结束状态。
6)选择结束方式,一般是系统的原始状态。
7) 在每个列监视器的用户名下,输入要保存的名称。
8) 用代码代替相应的 DNA 序列标记每个收集瓶。
9) 打印出每列设置的详细信息。
10) 检查打印信息是否正确。
11) 运行StartColumn 步骤,检查每一列的位置,确保合成器上的合成列处于正确位置。
12)检查与合成器相连的溶剂残留物(废液瓶)是否已满。
13)如果使用部分收集器收集DMT各脱保护步骤的流出物,确保试管足够干净,打开部分收集器,确保DMT废液管线通向部分收集器。
14) 启动循环,运行启动程序,清洗试剂管路,取出原试剂。
注:TritylOnAuto 表示合成寡核苷酸的5端有一个DMT,从固体载体上切下,保存在收集瓶中; TritylOffAuto 表示合成寡核苷酸 5. 末端核苷酸无保护基团,从固体载体上切下,保存在收集瓶中; TritylOnManual是指合成寡核苷酸的5末端核苷酸有DMT,寡核苷酸没有从固体载体上切下来,但保存在合成柱中; TritylOffManual是指在合成寡核苷酸的5中,末端核苷酸没有保护基团,寡核苷酸没有从固相支持物上切断,而是留在合成柱中