气相色谱仪往往由于生产连续性的需要，通常都24h运行，很难有机会对仪器进行系统清洗、维护。一旦有合适的机会，就有必要根据该实验室仪器运行的实际情况，尽可能的对仪器的重点部件进行彻底的清洗和维护。
由于进样等原因，进样口的外部随时可能会形成部分有机物凝结，可用脱脂棉蘸取丙酮、甲苯等有机物对进样口进行初步的擦拭，然后对擦不掉的有机物先用机械方法去除，注意在去除凝固有机物的过程中一定要小心操作，不要对气相色谱仪部件造成损伤。将凝固的有机物去除后，然后用有机溶剂对仪器部件进行仔细擦拭。
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