气相色谱仪冷柱上进样缺点主要有以下几点：
1、与分流－不分流进样相比，冷柱上进样的进样体积小，大的进样量容易造成柱超载。
2、操作复杂，对初始温度、溶剂种类和进样速度等要求较严格，且需要特殊的注射器。
3、容易有大量不挥发样品结在色谱柱进口端，造成色谱柱污染，样品记忆效应较为明显。
4、在溶剂峰前面流出的组分很难实现聚焦，测定较困难。
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