原始细胞库的数量是根据实际来计算的，每个品种可能都不一样。需要考虑后续生产、检定需要、保藏年限，检测用数量、复检频率等，主细胞库和工作细胞库冻存多少数量，根据你自己的需要确定，只要保证后续生产、检定需要足够即可，即遵循“够用原则”，多也是浪费。一般经验来说，原始细胞库冻存几十支，比如20支，主细胞库几十支，比如50支，工作细胞库一两百支，比如50-200支，够生产几十年了。
主细胞库和工作细胞库应分别存放。每一个库应在生产设施内至少2个不同的地点或区域存放。应检测并维护细胞库冻存容器，以保证细胞库贮存在一个高度稳定的环境中。
非生产用的细胞和生产用细胞严格分开存放。
每种细胞库均应分别建立台账，详细记录放置位置、容器编号、分装及冻存数量，取用记录等。细胞库中的每支细胞均应具有细胞系/株名、代次、批号、编号、冻存日期，贮存容器的编号等信息。
为保证细胞冻存后仍具有良好的活力，冻存前的细胞活力应不低于90% ，冻存后应取一定量的可代表冻存全过程的冻存管复苏细胞，复苏后细胞的活力应不低于80%。二倍体细胞冻存后，应至少做一次复苏培养并连续传代至衰老期，检查不同传代水平的细胞生长情况。细胞冻存后，可通过定期复苏细胞及复苏后细胞的活力数据验证细胞在冻存及贮存条件下的稳定性。
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