对细胞和组织研究

      某些测序方法，例如Smart-Seq2，能够利用从极少量细胞(大约1-1000)中提取的RNA来测定转录组，因此能够分析细胞数目极低、细胞类型罕见或依赖于生物标记材料的临床样本。许多研究已经确定了低输入或降解RNA样本的zuijia处理程序和分析方法。全血防腐剂和稳定剂的使用也使得利用极少量血获取高质量数据成为可能。然而，将转录组分析应用到临床样本(如组织和已分类的细胞群)在样本采集、样本处理和组织分离方面遇到了独特而重大的挑战。例如，多中心研究常常需要对患者样本进行集中处理，这种转移有引入偏倚的风险。此外，RNA质量在组织之间可能存在很大差异，这或许会影响实验设计。对于**或难以处理的样品而言，仅靠获取足够的高质量样品并不总能实现高RNA质量目标队列的规模要求。

 

     以往的研究很少关注RNA测序过程中由于样本处理而引入转录组数据的人为因素。对于微阵列或定量PCR产生的表达谱，已有研究发现一些能够影响结果数据的因素。其中一项研究表明，标准白细胞采集程序之前的培养时间可以迅速改变血液的转录组。在4°C进行运输可能会减轻这些变化，但无法完全消除影响。另一个研究利用微阵列技术探寻了时间、温度和保存对分离外周血单核细胞(PBMCs)转录组的影响：每一种保存材料都对转录组有影响，但依赖于大量的血液。到目前为止，只有少数的研究阐明了通过白细胞分离方法和低输入RNA测序所引入的人为影响因素。