产品名称：B疱疹病毒染料法荧光定量PCR试剂盒

JC病毒染料法荧光定量PCR试剂盒
产品及特点：
JC 病毒（John Cunningham Virus，JCV）属于乳多空病毒科（Papovaviridae）多瘤病毒属（Orthopolyomavirus），1971 年从进行性多灶性白质脑病（ progressivemultifocal leukoencephalopathy，PML）患者的脑中分离并以该患者名字命名，普通人群血清阳性检测率为 40%~60%，因 AIDS 并发 PML 的患者致死率约为 50%，对于免疫力缺陷和免疫力低下的既往感染者，还会引起多瘤病毒相关性肾病（polyomavirus-associated nephropathy，PVAN）、病毒血症等相关，并与胃癌、肺癌、食管癌等癌症的发生密切相关，但其致病机理尚未阐明。由于目前无特异的预防和方法，因此在病毒感染早期的准确检测对的诊断和十分关键，尤其在免疫低下的人群中实现高效、精准、及时的检测至关重要。为此本公司开发了简单快捷的 JC 病毒染料法荧光定量 PCR 检测试剂盒，它具有下列特点：
1. 即开即用，用户只需要提供病毒样品。
2. 根据JC病毒保守序列设计的专一性引物，与相关病毒无交叉反应。
3. 灵敏度可以达到几百拷贝/反应。
4. 一管式荧光定量 PCR 检测，避免后续污染。
5. 本试剂盒足够 50 次 20μL 反应体系的荧光定量 PCR。
规格及成分：

编号	成分	规格
试剂一	2×qPCR MagicMix	500 μL（棕色管）
试剂二	荧光 PCR 专用模板稀释液	1 mL（黄盖）
试剂三	JC病毒染料法PCR 引物混合液	100 μL（白盖）
试剂四	JC病毒染料法PCR 阳性对照(1×10E8 /μL)	50 μL（红盖）
试剂五	DNA 病毒裂解液（试用装）	15 次（9 mL）
	使用手册	1 份

运输及保存：
低温运输、-20℃保存，有效期一年。
自备试剂：
DNA模板、10×ROX(根据机型决定，具体见使用方法)。
使用方法：
一、稀释PCR阳性对照(以10E2-10E7拷贝/μL这6个10倍稀释度为例)：
1. 注意：由于标准品浓度非常高，因此下列稀释操作一定要在独立的区域进行，千万不能污染样品或本试剂盒的其他成分）。为增加产品稳定性和避免扩散传染性病原，本产品不提供活体样品做阳性对照，只提供可以直接使用的 DNA 片段作为阳性对照。
2. 标记 6 个离心管，分别为 7，6，5，4，3，2。
3. 用带芯枪头分别加入 45 μL 荧光 PCR 专用模板稀释液（好用带芯枪头，下同）。
4. 在 7 号管中加入 5 μL 1×10E8 拷贝/μL 的阳性对照，充分震荡 1 分钟，得1×10E7 拷贝/μL 的阳性对照。放冰上待用。
5. 换枪头，在 6 号管中加入 5 μL 1×10E7 拷贝/μL 的阳性对照(上步稀释所得)，充分震荡 1 分钟，得 1×10E6 拷贝/μL 的阳性对照。放冰上待用。
6. 换枪头，在 5 号管中加入 5 μL 1×10E6 拷贝/μL 的阳性对照到 5 号管中，充分震荡 1 分钟，得 1×10E5 拷贝/μL 的阳性对照。放冰上待用。
7. 重复上面的操作直到得到 6 个稀释度的阳性对照。放冰上待用。
二、样品DNA的制备：
8. 如果有 N 个样品，必须设置 N+2 个提取，多出的一个是 PC（样品制备阳性对照），一个是 NC（样品制备阴性对照）。可以用 10μL 上步制备的 PCR 阳性对照的第 4号（浓度为 1×10E4 拷贝/μL，10μL 相当于 1 万拷贝）或第 5 号（浓度为 1×10E5拷贝/μL，10μL 相当于 10 万拷贝）再加上一定量的水使总体积跟每次制备要求的体积一样，以此作为 PC。另外用水作为 NC。如果每次制备需要 200μL 样品，则 PC 和 NC 的体积也必须是 200μL。
9. 用自选方法纯化样品的 DNA，本试剂盒跟市场上大多数病毒 DNA 提取试剂盒兼容。也可以选购本公司的一管式病毒 DNAout 或其升级版柱式病毒 DNAout。本试剂盒免费赠送 15 次一管式病毒DNAout。
JC病毒染料法荧光定量PCR试剂盒
三、设置qPCR反应(20μL体系，在样品制备室进行)：
10. 如果只做 1 次重复，则标记 N+9 个 PCR 管，其中 N+2 个用于上步得到的 N+2 个样品，1 个用于 PCR 阴性对照，6 个用于 PCR 阳性对照。如果做 2-3 次重复，则反应设置数量相应增加 2 或 3 倍。
11. 在标记管中按下表加入各成分(本表只列出一次重复。样品管和阴性对照设置完毕后才设置阳性对照，并且阳性对照样品要等所有管子盖上盖子储存好后加)：

成分	样品管 N+2个	PCR阴性对照管	PCR阳性对照管(2-7管)
2×qPCR MagicMix(棕色管)	10μL	10μL	各10μL
JC病毒PCR引物混合液(白盖）	2μL	2μL	各2μL
自备10×ROX(见注)	2μL	2μL	各2μL
N+2待测样品DNA模板	6μL	不加	不加
第7步所得PCR阳性对照稀释液(2-7号)	不加	不加	各6μL2号样到2号管,3号样到3号管

注: 仅 ABI7500、7700 和 7900 仪器需要使用 ROX 作为对照，其他荧光 PCR 仪器（如 iCycler IQ、MJ Option、MJ Chromo4、MX3000、MX4000、RotorGene3000、RotorGene 6000 和 LightCycler480）不需要使用 ROX，则用水替代。
12.盖上盖子后上机，按下面参数进行PCR(具体PCR参数可以根据仪器不同而自行优化)。

过程	温度	时间
预变性	92℃	5分钟
PCR反应30个循环	94℃	60秒
	50℃	60秒
	72℃	60秒

13.数据采集
具体操作按所用仪器推荐的流程进行。本产品中所含的荧光染料在不结合DNA时，吸收光谱在471nm，结合DNA时的大吸收光谱在500nm，大发射光谱在530nm。信号采集可以设置在复性或延伸步骤。
四、数据处理：
14.如果把本试剂盒用于定量检测，则以阳性对照浓度的log值为横轴，以Ct值为纵轴，绘制标准曲线。再以待测样品的Ct值从标准曲线上推算出样品DNA浓度的log值，再推算出其浓度。
15. 如果把本试剂盒用于定性检测，只判断阳性或阴性，则阴性对照Ct必须大于或等于40。阳性对照必须有荧光对数增长，有典型扩增曲线，Ct值应该小于或等于30。对待测样品，如果其Ct大于或等于40则为阴性，如果小于或等于35则为阳性。如果在35-40之间，则重复一次。重复实验的Ct值如果大于或等于40则为阴性，如果小于40，则为阳性。