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PCR反应条件温度与时间设置

日期:2024-11-07 16:33
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摘要: PCR反应条件的选择技巧主要体现在温度、时间和循环次数上,温度过高,延伸时间不够都会对实验结果有很大的影响,下面详细了解: 1、变性温度与时间 变性温度低,解链不*是导致PCR失败的zui 主要原因。一般情况下,93℃~94℃lmin足以使模板DNA变性,若低于93℃则需延长时间,但温度不能过高,因为高温环境对酶的活性有影响。此步若不能使靶基因模板或PCR产物*变性,就会导致PCR失败。 2、延伸温度与时间 Taq DNA聚合酶的生物学活性: 70~80℃ 150核苷酸/S/酶分子 70℃ 60核苷酸...

PCR反应条件的选择技巧主要体现在温度、时间和循环次数上,温度过高,延伸时间不够都会对实验结果有很大的影响,下面详细了解:

1、变性温度与时间

 
变性温度低,解链不*是导致PCR失败的zui 主要原因。一般情况下,93℃~94℃lmin足以使模板DNA变性,若低于93℃则需延长时间,但温度不能过高,因为高温环境对酶的活性有影响。此步若不能使靶基因模板或PCR产物*变性,就会导致PCR失败。
 
2、延伸温度与时间
 
Taq DNA聚合酶的生物学活性:
 
70~80℃ 150核苷酸/S/酶分子
 
70℃ 60核苷酸/S/酶分子
 
55℃ 24核苷酸/S/酶分子
 
高于90℃时, DNA合成几乎不能进行。
 
PCR反应的延伸温度一般选择在70~75℃之间,常用温度为72℃,过高的延伸温度不利于引物和模板的结合。PCR延伸反应的时间,可根据待扩增片段的长度而定,一般1Kb以内的DNA片段,延伸时间1min是足够的。3~4kb的靶序列需3~4min;扩增10Kb需延伸至15min。延伸进间过长会导致非特异性扩增带的出现。对低浓度模板的扩增,延伸时间要稍长些。
 
3、退火(复性)温度与时间
 
退火温度是影响PCR特异性的较重要因素。变性后温度快速冷却至40℃~60℃,可使引物和模板发生结合。由于模板DNA 比引物复杂得多,引物和模板之间的碰撞结合机会远远高于模板互补链之间的碰撞。退火温度与时间,取决于引物的长度、碱基组成及其浓度,还有靶基序列的长度。对于20个核苷酸,G+C含量约50%的引物,55℃为选择zui 适退火温度的起点较为理想。引物的复性温度可通过以下公式帮助选择合适的温度:
 
Tm值(解链温度)=4(G+C)+2(A+T)
 
复性温度=Tm值-(5~10℃)
 
在Tm值允许范围内, 选择较高的复性温度可大大减少引物和模板间的非特异性结合,提高PCR反应的特异性。复性时间一般为30~60sec,足以使引物与模板之间*结合。
 
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