1.WB
WB的蛋白经过加热变性之后都变成线性的结构。因此*好的抗体是采用非常特异序列的人工合成多肽的方法来做实验，结果也非常特异。
2.IP/CHIP
我们用抗体去结合生理状态下的蛋白质，因此IP的抗体使用纯化的天然蛋白制作的抗体来做，也可以用纯化的重组蛋白的抗体。不要用人工合成多肽制作的抗体，因为这种抗体识别的位点可能被深深地藏在了蛋白的内心深处。CHIP和IP没有太大的区别，唯 yi 的问题在于，如果抗体识别的表位和该蛋白质与DNA结合的部位一致，则会导致CHIP实验的失败。
3. IF/IHC
免 疫荧光和免 疫组化中需要进行固定一步，固定是为了尽量让细胞的形态结构维持和原有的一致。这种化学物质的固定使蛋白质变性凝固，与天然状态下的蛋白质有了一定的区别，但是又不同WB中加热变性变成了线性的结构。因此在做IF/IHC实验中，合适的抗体可以是纯化的重组蛋白得到的抗体，也可以是人工合成多肽得到的抗体（多肽是在蛋白质的表面）
4.FC
流式细胞中分为两种，一种是活细胞的流式，这种流失采用是天然蛋白或者重组蛋白的抗体来做，另外一种是经过固定之后的流式，和IF/IHC 所用抗体一致。 在做流式细胞中，我们有直接标记和间接标记，间接标记不如直接标记真实准确。因此我们选择流式抗体要采用带有荧光标记的抗体；如果研究的蛋白没有直接标记的抗体，那么就采用间接标记抗体，需要添加荧光二抗。