对照扩增有信号排查各操作环节是否有不当,造成交叉污染分析:
1、引物设计不够优化。应避免引物二聚体和发夹结构的出现。
2、引物浓度不佳。适当降低引物浓度,并注意上下游引物的浓度配比。
3、镁离子浓度过高。适当降低镁离子浓度,或选择更适合的mix试剂盒。
4、模板有基因组的污染。RNA提取过程中避免基因组DNA的引入,或通过引物设计避免非特异性扩增。
5、交叉污染。在所用的试剂中有交叉污染, 或操作环境中有气溶胶造成污染, 建议对操作环境进行处理, 或者更换新的环境、加样器、枪头以及所有的引物、试剂等。