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PCR 反应体系各个组份概述
PCR
反应体系
由反应缓冲液(
10
×
PCR Buffer
)、脱氧核苷三磷酸底物(
dNTPmix
)、 耐热
DNA
聚合酶(
Taq
酶)、寡聚核苷酸引物(
Primer1
,
Primer2
)、靶序列(
DNA
模板) 五部分组成,各个组份都能影响
PCR
结果的好坏。
1
、反应缓冲液:
一般随
Taq DNA
聚合酶供应。标准缓冲液含:
50mM KCl
,
10mM Tris-HCl
(
pH8.3
室温),
1.5mM MgCl2
。
Mg2+
的浓度对反应的特异性及产量有着显著影响。浓度过高,使反应特异性降低;浓度过低,使产物减少。在各种单核苷酸浓度为
200
μ
M
时,
Mg2+
为
1.5mM
较合适。若样品中含
EDTA
或其它螯合物,可适当增加
Mg2+
的浓度。在高浓度
DNA
及
dNTP
条件下进行反应时,也必须相应调节
Mg2+
的浓度。一般 以
1.5-2mM
(终浓度)较好。
2
、
dNTP
:
高浓度
dNTP
易产生错误掺入,过高则可能不扩增;但浓度过低,将降低反应产物的产量。
PCR
中常用终浓度为
50-400
μ
M
的
dNTP
。四种脱氧三磷酸核苷酸的浓度应相同,如果其中任何一种的浓度明显不同于其它几种时(偏高或偏低),就会诱发聚合酶的错误掺入作用,降低合成速度,过早终止延伸反应。此外,
dNTP
能与
Mg2+
结合,使游离的
Mg2+
浓度降低。因此,
dNTP
的浓度直接影响到反应中起重要作用的
Mg2+
浓度。
3
、
Taq DNA
聚合酶酶:
在
100
μ
l
反应体系中,一般加入
2-4U
的酶量,足以达到每
min
延伸
1000-4000
个核苷酸的掺入速度。酶量过多将导致产生非特异性产物。但��,不同的公司或不同批次的产品常有很大的差异,由于酶的浓度对
PCR
反应影响极大,因此应当作
预试验或使用厂家推荐的浓度。当降低反应体积时(如
20
μ
l
或
50
μ
l
),一般酶的用量仍不小于
2U
,否则反应效率将降低。
4
、 引物
:引物是决定
PCR
结果的关键,引物设计在
PCR
反应中极为重要。
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