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PCR的循环参数解析

PCR的循环参数解析:


1.  预变性(Initial denaturation)


模板DNA完全变性与PCR酶的完全激活对PCR能否成功至关重要,建议加热时间参考试剂说明书,一般未修饰的Taq酶激活时间为两分钟。


2.  循环中的变性步骤


循环中一般95℃,30秒足以使各种靶DNA序列完全变性,可能的情况下可 缩短该步骤时间,变性时间过长损害酶活性,过短靶序列变性不彻底,易造成扩增失败。


3.  引物退火(Primer annealing)


退火温度需要从多方面去决定,一般根据引物的Tm值为参考,根据扩增的长度适当下调作为退火温度。然后在此次实验基础上做出预估。


退火温度对PCR的特异性有较大影响。


4.  引物延伸


引物延伸一般在72℃进行(Taq酶合适温度)。但在扩增长度较短且退火温度较高时,本步骤可省略


延伸时间随扩增片段长短而定,一般推荐在1000 bp以上,含Pfu及其衍生物的衍生设定为1 min/kbp。


5.  循环数


大多数PCR含25-40循环,过多易产生非特异扩增。


6.  zui后延伸


在zui 后一个循环后,反应在72℃维持5-15分钟.使引物延伸完全,并使单链产物退火成双链。