PCR反应没有回收到目的片段需要做什么?
1、涂布未转化的感受态细胞,如有菌落,表明氨苄霉素失效,或有氨苄抗性的杂菌污染。
2、转化完整质粒,计算菌落生长数,测定转化效率。转化率=产生菌落的总数/铺板DNA总量,铺板DNA总量是转化反应所用的量除以稀释倍数。例如将1ul的质粒(1ug/ul)用于100ul感受态细胞转化。再将1ul转化后的感受态细胞稀释至1000ul后(含有10ng DNA),用100ul铺板(含有1ng DNA)。过夜培养后得到了1000个菌落。转化率=1000菌落数×103ng/铺板1ng DNA=106 cfu/ug。低于108cfu/ug,转化效率低,应重新进行细胞转化。
3、如用pGEM-T作为阳性对照,产生了超过20-40个蓝斑,表明载体失去T。可能是连接酶污染了核酸酶,需更换核酸酶。