1、基因突变的重复性
基因突变的重复性是指已经发生突变的基因，在某种条件下，还可能再次独立地发生突变而形成其另外一种新的等位基因形式。也就是说，任何一个基因位点的突变可能会以一定的频率反复发生。某一基因座上的基因A可突变为其等位基因a；基因a有可能独立地发生突变形成其新的等位基因a1；同样地，a1也可能再次地发生突变而形成其另外的等位基因a2；a2还可能突变为a3，就其群体遗传学效应而言，基因重复突变与基因多向突变的结果相似，也是群体中复等位基因存在的主要成因之一。
2、基因突变的可逆性
基因突变的发生方向是可逆的。正突变(forward mutation)指显性基因A→隐性基因a；反突变(reverse mutation)指隐性基因a→显性基因A。通常认为，野生型基因是正常、有功能基因；而开始的基因突变往往是野生型基因突变而丧失功能、发生功能改变，表现为隐性基因，所以反突变又称为回复突变。一般来说，回复突变率远低于正向突变率。