典型操作对拍摄有电泳图像的 X光片进行扫描，将图像数字化后输入计算机。使用软件，分别对一组样品中的A、 T、 C、 G 四个泳道进行扫描，将扫描数据存入内存缓冲区。根据缓冲区中的扫描数据进行序列判读，并可绘制、打印吸收峰曲线或虚拟电泳图解。对所测得的序列进行必要的分析，如：识别启始码／结束码翻译成蛋白质序列等。