2005年7月，根据国家经济和社会发展的战略需求和科学前沿发展的*新趋势，科技部在人口与健康、农业、能源、生态环境、先进制造、工程与材料等国家重大需求领域和若干重要新兴交叉科学领域公开发布了16个方向的国家重点实验室建设指南。经各主管部门择优推荐，共受理申请44份。9－11月，科技部组织专家，进行了材料评审和现场考察两轮评审，根据专家评审意见，*终立项17个实验室。12月－今年3月，各主管部门组织有关单位进行实验室主任招聘并制定实验室建设计划。今年4－7月，空间天气学等17个实验室分别通过了科技部组织的建设计划可行性论证。通过论证，实验室明确了建设目标，制定了内容具体、操作性强的建设方案。
这17个实验室分别是：空间天气学国家重点实验室、汽车车身先进设计制造国家重点实验室、亚稳材料制备技术与科学国家重点实验室、卫星海洋环境动力学国家重点实验室、眼科学国家重点实验室、数字制造装备与技术国家重点实验室、电子薄膜与集成器件国家重点实验室、医学**学国家重点实验室、大陆动力学国家重点实验室、多相复杂系统国家重点实验室、轨道交通控制与**国家重点实验室、化工资源有效利用国家重点实验室、矿床地球化学国家重点实验室、煤炭资源与**开采国家重点实验室、水沙科学与水利水电工程国家重点实验室、家畜疫病病原生物学国家重点实验室和城市和区域生态国家重点实验室。
这17个实验室正式进入建设期。根据《国家重点实验室建设与管理暂行办法》，国家重点实验室建设期一般不超过两年，建设计划完成后，科技部将组织专家进行验收，验收通过后将正式进入国家重点实验室序列。