固相萃取洗脱液的流速太快，会造成保留或洗脱不完全；流速太慢则增加工作时间。一般来说，流速不超过5ml/min，而离子交换萃取管则不大于2ml/min。在通常习惯的柱色谱，如D101大孔树脂、聚酰胺、氧化铝等，自然流速适中时可不加调控；当流速太快时，则用带活塞的管柱调节；当吸附剂粒度细、自然流速太慢时，则需要施加外力，如加压、减压或离心。