随着高通量测序技术的飞速发展,越来越多物种的基因组信息得到**了解,这为更多的学者们研究相同物种不同个体间的基因变异提供了便捷。对已知序列的微生物基因组进行重测序,通过序列比对,可以进行个体或群体间的差异分析,找到大量的SNPs(单核苷酸多态性位点),InDel(插入缺失位点Insertion & Deletion)、SV(结构变异位点Structure Variation),具有深远的临床意义。 南京普东兴生物科技有限公司针对不同需求的合作伙伴,制定了研究方向,选择不同的测序深度,可以进行三种类型的**基因组测序,包括微生物基因组框架图,精细图,完成图;可以灵活选择测序方案,构建**基因组精细图。
图 **基因组圈图及COG分析
样本接收: 一、基因组DNA。样本量:m≥6μg;浓度:c≥30 ng/μL;纯度OD260/280≥1.8~2.0,OD260/230≥2.0 二、50ml新鲜培养菌液。
实验流程:
信息分析项目: 一、基本信息分析 按标准流程进行base calling、raw data数据整理及数据质量评估。 二、标准信息分析 1、基因组重测序分析 2、与参考基因组比对(共线性) 3、基因组岛鉴定 4、SNPs和InDel的检测及在基因组的分布 5、CNV和SV的检测及在基因组的分布 6、包含变异基因的COG和GO富集分析 7、包含变异基因的代谢途径分析(KEGG pathway) 三、根据客户需求进行个性化分析
普朗医疗是一家集研发、生产、销售、服务为一体的医疗企业,公司产品畅销海内外,广受好评!目前,普朗医疗与东南大学共同投资创办了南京普东兴生物科技有限公司,专业从事高通量基因测序仪及配套试剂的研发、生产和销售,并全方位的为客户提供数据分析和信息服务。产品主要应用于科学研究、个性化医疗健康、临床检测、生物生态分析等领域。目前,微生物全基因组重测序服务http://www.pl999.com/productinfor.php?anclss=9&nclass=34&id=124 项目的测序核心技术及配套试剂已经成熟,并将于未来大规模产业化发展。国内免费咨询电话:400-6656-888。 希望你我的合作将共同搭建一个幸福的桥梁!