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中国机构出援手 对EHEC进行测序和基因组分析

发布时间:2011-05-30

中国机构出援手对EHEC进行测序和基因组分析

5月中旬,一种被称为EHEC(肠出血性大肠杆菌)耐*****导致的疫情在德国北部集中暴发。

在过去一周内,共发现1000多例EHEC确诊或疑似病例,遍布德国16个州中的15个州,目前已证实有10人死亡。

EHEC疫情蔓延

515日,德国下萨克森州一位83岁老妇被发现有严重肠出血症状后,被紧急送往医院。21日,她在医院死去。不久之后,德国卫生部门证实,这位老妇被EHEC中的一种亚型感染。

情况还在恶化。524日早些时候,Bremen的一位年轻妇女也因感染EHEC在当地医院死亡;还有��位感染EHEC的妇女死亡原因尚不明朗。

不仅如此,目前感染EHEC的患者中,有40名重度患者情况不容乐观,他们不同程度地出现了肠出血、腹水和肾功能衰竭症状。

更可怕的是,此次流行的EHEC亚型是经过变异的耐*****,疑似超级**。

 当前的疫情超过了任何一次历**的状况,EHEC从没有在德国如此集中暴发。来自基尔市石勒苏益格荷尔施泰因(Schleswig-Holstein)医学院的生物学家Werner Solbach说。

事实上,德国每年大约有1000人感染此类**。然而*近一星期的感染人数,已经相当于过去一年的总和,且2/3是女性。

更令人担心的是,目前的疫情已经不限于德国。据德国媒体报道,与德国北部接壤的丹麦已出现一例初步确诊感染EHEC的病例和至少6例疑似病例。

不过,德国相关部门的反应速度值得称道。在不到半个月的时间里,卫生部门宣称找到了导致这次疫情的始作俑者。

524日,位于德国不伦瑞克的亥姆霍兹联合会传染病研究中心使用电子显微镜获得了此次感染的EHEC的电镜照片。而该国明斯特大学医院26日则宣布,此次疫情是由被称为“Husec41”EHEC亚型变异引起的。

同样是在26日,德国汉堡卫生研究所宣布,在产自西班牙的生鲜黄瓜中检测出了EHEC病菌,目前专家还无法排除其他食品携带这种病菌的可能性。

在德国北部,中国留学生秦涛(化名)则发现,他所在地区的超市已将**来自西班牙的黄瓜下架。

看来,EHEC以蔬菜为传染媒介有迹可循。

从此前**卫生组织(WHO)公布的研究资料来看,越来越多的EHEC暴发与食用水果和蔬菜(芽苗菜、生菜、凉拌卷心菜、色拉)有关,污染可能是由于种植或处理期间的某一阶段接触到了家畜或野生动物粪便所致。

中国疾控中心**科学家曾光向《科学时报》记者表示,中国疾控中心肯定在密切关注德国的疫情。但此外,他并未透露更多信息。

中国机构出援手

汉堡大学医学院主动和华大基因研究院取得了联系。欧洲华大市场总监韩新华说。

原来,汉堡大学医学院计划通过对该致病性大肠杆菌进行DNA测序,从而了解菌种的变异信息。鉴于欧洲华大的测序能力在欧洲已有了一定的知名度,他们在**时间寻求和中国伙伴的合作。

欧洲华大也作出**,不但会对这次发现的变种EHEC进行测序和基因组分析,而且不会收取任何费用。

 我们将协助德国研究人员尽快找出致病原因、确定**方案,以便及时采取有效的措施,防止疫情进一步恶化。另外,也会为其在**筛选、新药研发、后期预防等方面提供主要依据信息。韩新华说。

记者了解到,此次汉堡大学医学院委托的测序工作,将在中国深圳进行。在被问到什么时间可以公布结果时,韩新华称华大基因有几个不同级别的测序方案,但时间目前不好估计。

而一位不愿意透露姓名的专家告诉《科学时报》记者,大肠杆菌的基因组较小,测序在**左右即可完成,加上序列拼接和基因组分析,时间可能在数天内

EHEC的前生后世

作为大肠杆菌的一种,虽然EHEC可引起严重的食源性**,但大部分大肠杆菌是生存于人和温血动物肠道内的常见**,大多数菌株并无害。

EHEC属于大肠埃希氏菌,所导致的感染可以产生轻度腹泻、出血性肠炎(HC)、溶血性尿毒综合征(HUS)、血栓性血小板减少性紫癜(TTP)等。此次的变种亚型可引起较严重的溶血性尿毒综合征,并导致肾衰竭。

在此次疫情暴发之前,导致大规模疫病的EHEC多以O157H7血清型菌株为主,它是一种能产生志贺**的大肠杆菌。

1996年,日本暴发EHEC疫情,造成9451人发病,似与学校午餐中食用污染的萝卜缨有关;2006年,美国也遭受过一次EHEC侵袭,造成1人死亡、14人肾脏损伤,至少94人因此住院**。

而这次,发生在德国的EHEC感染与以往都有不同。

据德国媒体报道,以往超过八成的EHEC病人都在18岁以下,而这次大部分患者是成年人,而且大部分是注重健康的女性。

韩新华告诉《科学时报》,欧洲华大的德方合作单位确认,***对此次的EHEC病原几乎失效。

但中国疾控中心传染病研究所所长徐建国却有些不同意见。他告诉记者,EHEC对一些***耐药很正常。但是不是几乎**的***都失效,则需要经过很严格的实验调查。

事实上,对几乎*****都耐药的**以NDM-1为代表,但是目前它只在医院中有较多感染,传播能力并不强。

不管如何,这种疑似超级**会致严重的**后果。WHO认为,规范的卫生习惯可预防很多食源性**病菌的传播。

WHO建议,预防EHEC感染,关键要把食物煮透,至少使食物中心的温度达到70℃。多位卫生专家也表示,勤洗手和对生鲜蔬菜采取严格的卫生措施,将有效预防EHEC的感染。