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详细介绍温度梯度PCR和降落PCR有什么不同

发布时间:2012-07-02

详细介绍温度梯度PCR和降落PCR有什么不同?
1.
什么是温度梯度PCR?温度梯度PCR是指在退火温度不太明确时,为了找到**退火温度,在一台PCR仪上同时做多管PCR反应。每一管放在仪器内不同列或是不同行上,分别进行PCR反应。例如:在50-60℃可以分6管,分别为505254565860度。在不同的管类进行PCR反应。PCR反应后,经过电泳检测的比较,看看哪个温度的效果*好。总之是通过温度梯度PCR反应,来进行退火温度的*化。

2.什么是降落PCR?降落PCR是在同一个PCR管内进行PCR反应,只是每个循环的温度不同(如每个循环降1度)。一般兼并引物多采用这种方法。降落PCRtouchdown PCR),通过设计多循环反应的程序,以使相连循环的退火温度越来越低。由于开始时的退火温度选择为高于估计的Tm值,随着循环的进行,退火温度逐渐降到Tm值,并*终低于这个水平,用于确保**个引物模板杂交事件发生在*互补的反应物之间,即那些产生目的扩增产物的反应物之间。尽管退火温度*终会降到非特异杂交的Tm值,但此时目的扩增产物已开始几何扩增,在剩下的循环中处于超过任何滞后(非特异)PCR产物的地位。由于目标是在较早的循环中避免低Tm值配对,在TD—PCR中*好应用热启动技术。设计时,退火温度的范围应跨越15℃左右,从高于估计Tm值至少几度到低于它10℃。实验中如持续出现假象带(杂带),则是因为起始退火温度��低,或目的扩增产物和非目的产物的Tm值相差无几,或非目的扩增物以更高的扩增效率扩增,可把退火温度每降低1℃所需的循环数增加到34

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