蜡状芽孢杆菌是杆状的革兰氏阳性细丨菌，会引起食物中毒和其它疾丨病，例如角膜炎。蜡状芽孢杆菌可在从4°C到37°C的广泛温度范围内生长。实际上，蜡状芽孢杆菌引起的许多食源性疾丨病是由于未正确烹饪或未正确存储的食品（包括乳制品和肉类）造成的。引起的大多数食物中毒可分为两种症状：催吐型和腹泻型，这两种症状都是由细丨菌产生的肠毒丨素引起的。
衣原体的病原体——沙眼衣原体——革兰氏阴性细丨菌。细丨菌的传播是通过与被感染的体液接触而发生的，然后感染粘膜。可以在怀孕期间从母体传播给孩子，并感染引起结膜炎。女性卵巢，输卵管或子丨宫的感染会引起盆腔炎（PID），这可能导致受孕困难，异位妊娠或不孕风险增加。男性感染导致尿道炎，附睾炎和前列腺炎，如果不及时治丨疗，*终可能导致不育。
淋病奈瑟氏球菌是革兰氏阴性菌。通常成对感染人类细胞。它具有大约1Mbp的环状DNA基因组，可编码2000多个基因。淋病奈瑟氏球菌是通过性接触传播的，通常会感染男性尿道粘膜细胞或女性的子丨宫颈和尿道。在感染期间，细丨菌会释放出多糖，刺激宿主细胞产生引起炎症反应的肿瘤坏死因子。感染引起的男性并发症可能导致前列腺炎或睾丸炎。女性可导致输卵管炎或卵巢炎，其中任何一种感染都可能导致不育。
艰难梭菌是杆状的革兰氏阳性细丨菌。它是抗丨生素相关性腹泻和伪膜性结肠炎的主要病因。艰难梭菌对肠道的定殖通常与抗丨生素应用导致的天然肠道菌群的消除有关。尽管艰难梭菌感染可能很严重且威胁生命，特别是在老年人中，但由于许多患者无症状，因此在暴发期间难以诊断。检测艰难梭菌感染的传统方法是通过对细丨菌产生毒丨素的细胞毒性测试，但是这种方案通常需要很长的时间才能得出结论。
大肠杆菌O157：H7是杆状革兰氏阴性细丨菌。它是普通大肠杆菌的肠出血性菌株，O157：H7菌株感染通常与出血性结肠炎有关。大肠杆菌O157：H7被其体细胞（细胞壁） 抗原（O157）和鞭毛抗原（H7）识别。已知大肠杆菌O157：H7会产生类似志贺氏样的毒丨素，会引起严重的症状。尽管大多数患者可以从感染中恢复过来，但多达15％的患者可能会发展为溶血性尿毒症综合征，这是一种致命的肾衰竭。大肠杆菌O157：H7的感染通常是由于食用了准备不足的食物而引起的，包括未煮熟的肉，未经处理的水或未经巴氏消丨毒的生乳。
结核分枝杆菌是肺结核的病原体。结核病是一种多方面的疾丨病，在工业化国家和发展中国家都是具有挑战性的公共卫生问题。根据世界卫生组织的数据，每年诊断出880万结核病例，其中近200万人死亡。曾经被认为可以控制甚至接近灭绝的结核病，感染水平正在上升，而新的恶性的耐药性菌株加剧了这一威胁。*令人关注的是，缺乏及时准确的诊断结核分枝杆菌疾丨病的方法。早期诊断对于预防此类疾丨病进一步传播至关重要。
金黄色葡萄球菌通常被认为是奶牛群中传染性乳腺炎的*常见原因。据估计，高达90％的奶牛场都存在金黄色葡萄球菌感染，造成了奶业经济损失的35％。金黄色葡萄球菌是兼性厌氧的革兰氏阳性细丨菌。大多数金黄色葡萄球菌菌株是过氧化氢酶阳性和凝固酶阳性的，这构成了传统鉴定方法的基础。
霍乱弧菌是一种逗号形的革兰氏阴性细丨菌。它是人类霍乱的病因，会影响小肠上部。疾丨病的传播主要是通过受污染的食物或水。受霍乱影响的人表现出严重的水样腹泻和呕吐，这是由细丨菌产生的霍乱毒丨素引起的。霍乱的许多病例都危及生命，因为腹泻和呕吐会导致快速脱水和电解质流失。即使对其流行病学进行了广泛的研究，霍乱在世界范围内仍每年影响超过500万人。
新型隐球菌是一种包在荚膜内的酵母。新型隐球菌的感染被称为隐球菌病，是免丨疫系统较弱的患者（特别是晚期HIV / AIDS）中*常见威胁生命的脑膜炎病因。新型隐球菌在世界各地的土壤中普遍存在。吸入新雾化孢子会感染新型隐球菌。新型隐球菌从肺通过血行性传播到中丨枢神经系统，导致脑膜炎。尽管发达国家使用抗逆转录病毒疗法减少了隐球菌病的发生，但它在发展中国家仍是一个主要问题，并且是HIV / AIDS患者死亡的主要原因之一。治丨疗隐球菌病的主要挑战之一是许多隐球菌性中丨枢神经系统疾丨病患者在隐球菌性肺炎方面无症状，因此难以早期发现。
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