1. 用PDQuest软件或肉眼比对，找出感兴趣的蛋白点，并做好标记和记录。
2. 用MilliQ水冲洗胶2次。
3. 用色谱纯甲醇和MilliQ水冲洗Ep管
4. 将枪头(200l)下端剪去，使其内径略小于蛋白斑点的直径，用色谱纯甲醇和MilliQ水冲洗枪头。
5. 对准斑点中央小心将蛋白切割下来，放入Ep管，MilliQ水漂洗2次，如胶块太大，将其切成1 x 1 mm的胶片。
6. 将切好的点做好标记和记录，置-80oC保存或冻干后-20oC存放。
注意事项：
1. 尽量避免皮肤和头发的角蛋白的污染，在操作过程中应戴一次性的PE手套（不用乳胶手套）和帽子。
2. 不要将胶长期存放于乙酸溶液中。
3. Ep管及染胶的容器必须用甲醇和水充分清洗，尤其应与进行Western blotting的容器分开，以避免casein或BSA的污染。