1.显微镜不论在使用或存放时应避免灰尘、潮湿、过冷、过热、与含有酸碱性的蒸气。
2.不得将化学药品放在显微镜附近，更不得在显微镜箱内放有化学药品(干燥剂除外)。
3.显微镜应经常装上目镜，使灰尘不致落到物镜里面。
4.透镜的表面若有灰尘.应先用黄鼠狠毛笔拭去，然后再行擦拭。
5、透镜的擦拭只能用专用拭镜纸或棉球擦拭。
6.透镜表面若有污秽时，可用拭镜纸或棉球，蘸少许石油精或二甲苯轻轻擦拭不得用酒精，否则透镜胶层将被溶解。
7.油浸式的物镜使用后的擦拭须依上述方法进行，不得让香柏油在透镜面上千涸，更不得用酒精或类似液体浸洗镜头。
8.物镜里面的透镜应经常注意检查，用皮老虎(洗耳器)吹除灰垢。如必需擦拭时，须细心地用小木棍卷些棉球或擦镜纸轻轻擦拭，必要时可蘸少许石油精或二甲苯，*后用皮老虎吹除撩下的污垢.
9.切勿用二甲苯擦拭反光镜，以免水银变混浊状态，影响反光强度。
10.显微镜镜体与载物台，亦可用旧亚麻布或棉布，蘸些石油精擦拭.使用完毕后不
允许有残余的香柏油留存在上面。
11.管筒内的灰尘，可用羊毛织品摩擦过的滚棒吸去，或把目镜、物镜取下后，用旧牙刷轻轻刷扫，然后用皮老虎吹除。
12.齿轮与齿条的油脂及滑动槽面—亡的油脂，因日久灰尘污垢或硬化，致使粗动手轮转动发生困难，可用二甲苯将陈脂去除，然后擦上少许无酸动物油脂或无酸凡士林，不可用其他油脂，以免影响仪器。
13.显微镜上的目镜和转换盘上的物镜，不用对应套上软皮罩或相套，以防止灰尘侵入或将整个镜体用玻璃罩或布套罩住。
14.物镜装盒时盒内须清洁，装时透镜前片向上，则灰尘不易落到物镜后片上。