一个研究课题能够发表，关键看**性，而科研中，很多地方都可以有**性。但什么样的**是合适的呢。今天就给大家介绍个经典的思路。
① 研究目的：探索出－A基因通过B机制影响C**的D功能。
② **点：次报道A基因在C**中的D功能。
科研的灵魂在于**。也就是要做到别人没有做到的地方。需要把**放在A上。
今天主要讨论思路。
一、相关性研究
注意，这里的C**，如果是**，就是临床研究，如果不是**，那么就是基础科学研究。比如，DNA损伤修复，前几年比较热门的研究。很多高分**，并未涉及**。
那么这里的相关性研究是什么意思呢?
① 对于**研究。**组织和正常组织间，所研究的基因有差异。这个差异，可以是表达差异（研究多），可以是突变（这几年热门的GWAS突变检测，不过现在检测到的新突变，没有功能研究，发不了好**了），可以是修饰（表观遗传学）等等。Anyway，存在差异。不然这个基因就不叫这个**的相关基因了。在做的时候，样品量越多，检测方法越多，基因与**的相关性越紧密，这个数据就越好了。**档次也就高了。
② 对于非**。在生理情况下，不同条件下，基因有差异（差异同上，不过，这里表达差异占绝大多数，其实是修饰，突变基本很少）。比如说，DNA损伤修复。采用紫外诱导DNA损伤，看处理和非处理组间，基因的差异。有时需要做梯度相关性。
在这里，大家要注意，诱导条件的控制。尽量接近天然环境。曾经跟一位国外教授聊天，他说，他在一个研究中，不用CMV启动子了。问，为啥。回答，在细胞内并没有这类强启动子。如果用这类强启动子做过表达研究，已经不是细胞正常生理状态了。非正常生理状态下的结果，对于我们科研就没有啥意义了。
找到的差异基因，我们要问问。中国人讲究，因果。这几天有位学佛的朋友说，这个基础的道，就是因果。
为啥呢。这个差异基因，是这个**（科学现象，后面以**为代表）发**展的因，还是果呢。
讨论是因是果，就到细胞和动物模型上来看看是否有功能表型，这个功能表型与**的发**展是否存在相关性。
对于一个课题，科学性的评估，看了这**，您就明白了。但可执行性上，很多人就忽略了。这就是为什么，很多人拿到课题了，却没能发表好**。有的是没有做出来，有的是做不了。所以，经常会问，您这个课题，这个领域研究中一般用的细胞及动物模型是什么，您有吗，能做吗。
为啥要做机制呢，一个重要的答案是，没有机制，我怎么知道你这个是不是假阳性呢。所以，一个课题的深度就在于机制的深度。对于机制，做法简单分3类
①下游信号通路检测
这个比较多，就看看A基因改变后，下游信号通路改变如何。我们经常说，要站在巨人的肩膀上。因为A基因是新的，你的A基因是否比别人的A基因更重要呢，就看你的B是谁。B越高，你的A就越重要了。
② 下游分子功能相关
前面信号通路检测，只是分子表达相关。并不是功能相关。要深入，就再做做功能相关。
a、A干扰后，B下降，细胞有功能表型。那么单独把B干扰，功能表型是否跟A干扰一致。
b、A干扰后，B下降，细胞有功能表型。那么在A干扰的前提下，把B过表达，看细胞表型是否回复。这个就是大名鼎鼎的rescue实验。
重点说下，这个2，大家可以都是试试。如果结果OK，放**里面。大大提高**档次。如果不OK，说明A的功能不是通过B的，B的改变是非特异的。那么咋办呢。两个路径，一条，找到真正的功能B。**条，把1的结论放**里面，投认可1结果的杂志（你懂的，5分以内的，基本都认，有的5分以上的也认）。
③ 直接互作
这个不得了。就是找到与A直接互作的B。难度很大。这个地方需要有水平。以前与人聊天，说，只要发过3篇以上的JBC，在国外基本就可以申请associate位置了。为啥呢，JBC才4分多呀。因为这个杂志的研究工作，基本上都是直接互作的研究。技术能力达到这个水平了。只要以后能够找到一个**性的A，**也很重要，B也非常有名气。然后再跟nature，ence主编搭过讪，那就有机会上nature，ence，甚至cell了。
对于蛋白的直接B的寻找，方法很多。
如果A是个转录因子，那么机会就更大了。方案有两个
a. A干扰后做表达谱芯片，获差异基因listX。信息学分析A可以调控哪些基因，获基因listY，listX和listY取交集。交集基因，luc检测。如果OK，再CHIP或EMSA。如果还OK，要是要发10分20分。把B的rescue实验做出来。
b. CHIP on chip。具体大家百度下。不过，这里跟上面的CHIP一样，需要有好用的抗体。后要求也一样，如果要在短时间内搞定10分20分的reviewer。把B的rescue实验做出来。
一、经典的科研中，A基因通过B机制影响C**的D功能。**性在于A。一个课题要能够发表，A需要具备3个性质。
① **性。
② 临床相关性。
③ 功能。
有了这3个，基本上**就有了。如果要发得高，继续往下看。
二、经典的科研中，分3大块。
① 相关性数据。
② 功能数据。
③ 机制探讨。
这3个做齐了，加上上面的3,5分的**基本就有了。如果要发得高，就看每一步的踏实度了。如果要10分以上，就看机制的深度了。具体的参考3分5分10分的**分析。