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基于HRM技术的SNP.突变和甲基化检测-混匀仪技术文章
基于HRM技术的SNP.突变和甲基化检测-混匀仪技术文章
基于HRM技术的SNP.突变和甲基化检测-混匀仪技术文章
现阶段
,
大家检测
SNP
时都用一贯的检测方法
,
包括测序
,
探针还有
DHPLC
等等
,
而甲基化大多用
MSP.
至于
HRM
技术
(
高分辨率溶解曲线技术
)
并不为大家所熟知
,
有两个原因
:1)
适合做
HRM
技术的仪器太少了
,
而且在国内的普及程度不高
,
具我了解能够做
HRM
的有
Roche LightCycler 480,Qiagen Roter-Gene 6000,ABI 7500 Fast
和
ABI7900HT Fast,Idaho LightScanncer.
其中罗氏的
480
在其软件分析上是做的*好的
.2)HRM
的实验灵敏度太高
,
影响实验因素过多
,
很多人都做了
,
但是就是做不出来
.
因此就放弃
,
就换用其他比较成熟的方法
.
殊不知
,HRM
技术的检测方法有其他技术难以比拟的优势,不仅能实现高通量和高精度的同时
,PCR
和荧光定量在同一管内进行
,
能够有效避免假阳性
.
作为新一代的遗传扫描工具
,HRM
具有
"
简
,
效
,
快
,
廉
"
等其他技术难以比拟的优势
:
简
:
无需序列特异性探针
,
不受碱基位点局限
,
同时检出已知或未知突变、
SNP
和甲基化位点:闭管操作,避免交叉污染。
效
:*低检测
0.1%-0
,
01%
的突变或异常甲基化,检测
SNP
灵敏度和特异性均为
100%
。
快
:
1
次同时不多于
384
个样本,在
60-90
分钟内完成检测。
廉
:简化操作步骤、降低人工和试剂成本,费用远少于测序、
Taqman
探针等方法。
HRM
技术特别适用于
样本量多、检测位点较少的
SNP
、突变或甲基化分析
,是不同于基因芯片检测方法(检测位点多,样本少)的高通量方法。同时,也是
基因芯片筛选后的多个基因在更多标本中验证的*佳方法
。
转自生命科学论坛
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