所以不管影响DNA的外界因素有多少,我们先得了解DNA的稳定性内在因素是什么?
——DNA螺旋是通过每个碱基对之间的氢键和堆积的碱基对的疏水作用力而稳定的
有了上面这条,我们就可以分析各种外因是怎么来影响DNA的稳定性(即可以Tm值大小表示)了,呵呵:
1. 有机溶剂:用一般为非极性物质(如乙醇)降低了DNA周围介质的极性,则显然会降低碱基对的疏水作用力,因此会降低DNA的稳定性,Tm值也随之降低.
2. 离子强度:离子强度增大,增加DNA周围介质的极性,增加碱基对的疏水作用力,因此会增加DNA的稳定性,Tm值也随之升高. 在一定低离子强度以下,无需加热就使溶于其中的DNA出现不可逆变性
3. PH值:适度的PH值范围内的作用还有利于的DNA的稳定性,因为它跟离子强度的作用类似. 但极度的PH值(强酸或强碱)就不一样了,过量酸使A、G、C上的氮原子质子化,而过量碱会使G、T上的氮原子去质子化,这样都不利于氢键的形成。氢键的形成原理大致如此:它的结构形式是:A-H…Y,其中A要**电负性强的原子,吸引电子的能力比较强, 使氢原子几乎变成一个没有电子“裸质子”,由此氢原子带上正电,吸引带负电的Y原子而形成氢键。因此介质过酸或过碱都会吸引碱基与介质中的Y-结合,而不再与另一个碱基结合形成氢键。因此,DNA的稳定性也被打破。
4. (G+C)值:由于G与C之间比A与T之间多一个氢键,所以它们之间的稳定性要高些,而不同来源的DNA的GC含量不一样,所以导致不同来源的DNA的稳定性也不一样。它与Tm之间的关系可由下列的经验公式来表示:
X%(G+C)=2.44×(Tm - 69.3)转自生命科学论坛