中华人民共和国南京海关于1979年1月1日正式成立，这是党的十一届三中全会召开以后，我国在长江内河设立的**个海关机构。根据党中央关于机构改革的统一部署，2018年4月14日起，原江苏出入境检验检疫局职责和队伍划入南京海关。经过40年的发展，南京海关各项工作取得显著进步，已步入海关系统大关行列。
南京海关是受海关总署直接领导，负责指定口岸及相关区域范围内海关工作运行管理、监督监控的正厅级直属海关，领导隶属海关。南京海关管辖范围为江苏省的各项海关管理工作，主要负责本关区贯彻落实党中央、国务院关于海关工作的方针政策和决策部署，负责贯彻执行与海关管理相关的法律、法规、规章、规范性文件和相关技术规范，负责本关区征税、监管、缉私、出入境检验检疫、统计等工作，负责本关区基层党组织建设、队伍建设和日常管理工作。南京海关下辖金陵、苏州、苏州工业园区、无锡4个副厅级隶属海关，25个正处级隶属海关单位；机关内设1个副厅级机构、20个正处级机构。关区现有在职人员5600多名。
南京海关坚持以习**新时代中国特色社会主义思想为指导，认真贯彻落实海关总署“政治建关、改革强关、依法把关、科技兴关、从严治关”的总要求，坚持马上就办、真抓实干，近年来各项工作成绩突出，监管进出口总值、货运量、征收税款、检验检疫、统计分析等主要业务指标均位居国内海关前列；坚决贯彻总体国家**观，切实加强实际监管，保持打击走私高压态势，有效地维护了江苏口岸正常的进出口秩序；以促进江苏经济发展为己任，大力推进国内通关一体化、海关特殊监管区域整合优化等重点改革，着力优化外贸营商环境，为推动江苏省开放型经济高质量发展作出积极贡献。同时，南京海关认真贯彻落实新时代党的建设总要求，不断推动**从严治党向纵深发展，锻造“政治坚定、业务精通、令行禁止、担当奉献”的准**化海关纪律**。
