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藻胆蛋白的自我介绍之藻红蛋白篇

发布时间:2024-06-26

注: PE 和 APC 的完整操作步骤及标记方案在后两页,如果不需要看介绍,可直接跳过

 

(R-PE 及 B-PE)

1.从红藻中纯化

2.具有极高的发射量子产率

3.荧光团与蛋白质主链共价结合,不被淬灭

4.高水溶性


R-PE    与 B-PE    的 区 别 :

Wavelength (nm)


 

 


Wavelerngn (mm)


 

 

R-PE   与 B-PE    的 对 比 :

 

 

R-PE

B-PE

分子量

240,000

240,000

*大吸收

565 nm

545 nm

额外的吸收峰

498 nm

564nm

*大发射

573 nm

573 nm

消光系数(ε)

1.96x106 M-1cm-1

2.41x106 M-1cm-1

荧光量子产率(QY)

0.84

0.98

 

 

吸收比

 

A566/A280≥5.0

A566/A498<1.5

A620/A566<0.01

 

A545/A280≥5.5

A565/A496<2.7

A620/A545<0.01

 

 


1.从蓝藻中纯化

2.具有极高的发射量子产率

3.荧光团与蛋白质主链共价结合,不被淬灭

4.高水溶性

APC 和 C-PC  的区别:


 

APC 和 C-PC 的对比:

 

 

APC

C-PC

分子量

104,000

264,000

*大吸收

651nm

651nm

*大发射

662nm

647 nm

消光系数(ɛ)

7.3x105 M-1cm-1

1.53x106cm-1M-1

荧光量子产率(QY)

0.68

0.81

吸收比

A650/A620≥1.25

A650/A280≥4.5

A652/A620<0.3

A620/A280>4

 

APC    和 APC     的 对 比 :

1.APC    结构: 它具有α和β亚基,具有明显的(αβ)3 四级结构。

2.为什么要将APC 进 行 交 联 ? 

答 :交联是为了防止APC 在稀释或暴露于变性盐(如尿素或盐酸胍) 时

发生可逆解离,从而保持其结构和功能稳定。

3. 如何进行 APC 交联?

答:通过α和β亚基间的特异性  j联可以阻止APC 的分解。

 
交联比:>1.0


 

 

NaClO4

A650:A620

CL-APC

 

1.465849387

CL-APC+NaClO4

+

1.386850153/

 

 

NaClO4

A650:A620

APC

 

1.587272727

APC+NaClO4

+

0.317901235

注:图中的红色线条为没有添加NaClO4,   蓝色线条为添加了NaClO4。

如图及表中信息所示, CL-APC  图中添加NaClO4  及没添加NaClO4,   吸收比没有明显变化。而在未交联的APC

中, 添加NaClO4,    得到的吸收比有非常大的变化, 因为APC中加入了NaClO4  导致了它出现了解离。


2.

特 点 :

1.存在于大多数光合作用的甲藻中

2.高水溶性

3.大斯托克斯位移

 

 

 

PerCP

分子量

35,000

*大吸收

483nm

*大发射

676nm

消光系数(ε)

4.0x105 M-1cm-1

荧光量子产率(QY)

1.0

亮度(exQY)

4.9x105M-1cm-1

吸收比

A482/A280>4.0

 

 




 .P E 的 制 备

1.将 PE 纯化。缀合前的浓度通常为 5-10  mg/ml  。 注意: PE  在缀合前作为 SAS  ( 硫 酸 铵 钠 ) 沉

淀物*稳定。如果将 PE   以 SAS   沉淀物的形式储存,则必须在使用前进行大量纯化。

2.使用3 .5毫克R-PE 修饰每毫克lgG,    包括在缓冲液交换过程中损失的额外10%。

3. 检查 PE  的纯度和浓度,请测量280、565 和 6 2 0 nm   处的吸光度。  (1  mg/ml      的 PE  在 565nm   处的 OD  为 8 . 2 ) 。 5 6 5 / 6 2 0 比 率 > 5 0 表示已充分去除污染的藻蓝蛋白;565/280 比 率 > 5 表示已充分去除所有其他蛋白质。

 

.P E 的 活 化

1.使用前在无水 DMSO   中制备 10  mg/ml     的 SMCC  储备溶液。

2.每毫克 PE 加 入 1 1 μlSMCC,    并进行涡旋。将反应管用铝箔包好,室温下旋转60 分钟。

3.将纯化的 PE  过凝胶过滤柱来交换缓冲液。

注意:对于失败或效果较差的结合,增加或减少 SMCC   相对于 PE   的量,可能会有所好转。

 

. 1gG    还 原

1.在蒸馏水中制备 1 M  DTT(15.4       mg/100       μl)  的新鲜溶液。

2.1gG  溶液浓度应为 4 mg/ml   或更高,这样效果比较好。还原几乎可以在任何缓冲液中进行; MES 、 磷酸盐和 TRIS    缓冲液 (pH     范围为 6 至8)已被验证可以使用。如果抗体浓度低于 2  mg/ml,   则应浓缩。缓冲液交换柱上的损失应额外增加10%。

3.用 DTT  配制 20 mMlgG    溶液:每毫升 IgG   溶液加入 20μ lDTT      原液并搅拌。室温下静置30

分钟,无需额外搅拌 (以尽量减少半胱氨酸再氧化为胱氨酸)。

4.将还原的lgG 通过预平衡的“交换缓冲液”过滤柱。收集0.25毫升的级分,测定蛋白浓度,并将含

有大部分lgG 的级分汇集在一起。可以通过分光光度法或比色法完成。

5.此步骤后尽快进行缀合。

注意:对于结合较差或失败的情况,降低 DTT   浓度可能会有所帮助。

 

.进 行 缀 合

1.每毫克 IgG 添 加 3.2 毫克 SMCC-PE。    用铝箔包裹反应管并在室温下旋转60 分钟。注意:这些

( 每 IgG   约 2 个 PE)   效果很好。对于失败或效果不佳的结合,不同的摩尔比可能会有所帮 助。

2.60 分钟后,必须去掉 lgG   上未反应的游离巯基。

3.在 1.0 ml 干 DMSO   中制备 10 mg  NEM  的新鲜溶液。

4.每 毫 克 |gG  添加 34μ g(3.4μl)       。 室温下包裹并旋转20 分钟。

 


 

1.


2.60 分钟后,必须去掉 lgG   上未反应的游离巯基。

3.在 1.0 ml  干 DMSO  中制备 10  mg  NEM  的新鲜溶液。

4.每毫克 |gG 添加 34μ g(3.4μl)      。 室温下包裹并旋转20 分钟。

 

 

 

1:整个缀合过程可以在 **内完成。但是,缀合前对APC 的纯化可能需要24-48小时。除了下面

列出的材料外,您还需要浓度至少为 2 mg/ml   的抗体溶液。请您在进行APC 抗体缀合实验之前熟悉

如何使用脱盐柱以及如何获取吸光度光谱。

2 : SMCC-APC    缀合物非常稳定(在“交换缓冲液”中,在4C 下至少可以稳定几个月)。因此,  如果您需要节省一部分时间,可以选择同时缀合10 毫克或更多的 APC,  并将其用于几次抗体实验(

在几周内)。 SMCC-APC     的长期储存*好是作为饱和硫酸铵沉淀物。

 

 .A  PC 的 制 备

1.将 APC  纯化。缀合前的浓度通常为 5-10  mg/ml  。 注意: APC  在缀合前作为 SAS  (硫酸铵钠)

沉淀物*稳定。如果将 APC   以 SAS   沉淀物的形式储存,则必须在使用前进行大量纯化。在用每毫 升 1 升的“透析缓冲液”透析之前,用每毫升1 升 APC   的 PBS   进行透析2 次。

2.使用1 .7毫克APC 修饰每毫克lgG,    包括在缓冲液交换过程中损失的额外10%。

3.检查 APC  的纯度和浓度,请测量280、620和655 nm   处的吸光度。   (1 mg/ml    的 APC  在 655nm   处的 OD  为 5 . 9 ) 。 655/620   比 率 > 1 . 4 表明杂质被充分去除;  655/280    比 率 > 4 表 明所有其他蛋白质均已充分去除

 .A   PC 的 活 化

1.使用前在无水 DMSO   中制备 10  mg/ml     的 SMCC  储备溶液。

2.每毫克 APC  加 入 6 μlSMCC,    并进行涡旋。将反应管用铝箔包好,室温下旋转60 分钟。

3.将纯化的 APC  过凝胶过滤柱来交换缓冲液。

注意:对于失败或效果较差的结合,增加或减少 SMCC   相对于 APC   的量,可能会有所好转。

 

. 1gG    还 原

1.在蒸馏水中制备 1 M  DTT(15.4       mg/100       μl)  的新鲜溶液。

2.1gG  溶液浓度应为 4 mg/ml   或更高,这样效果比较好。还原几乎可以在任何缓冲液中进行; MES 、 磷酸盐和 TRIS    缓冲液 (pH     范围为 6 至8)已被验证可以使用。如果抗体浓度低于 2  mg/ml,   则应浓缩。缓冲液交换柱上的损失应额外增加10%。

3.用 DTT  配制 20 mMlgG    溶液:每毫升 IgG   溶液加入 20μ lDTT      原液并搅拌。室温下静置30

分钟,无需额外搅拌 (以尽量减少半胱氨酸再氧化为胱氨酸)。

4.将还原的lgG 通过预平衡的“交换缓冲液”过滤柱。收集0.25毫升的级分,测定蛋白浓度,并将含

有大部分lgG 的级分汇集在一起。可以通过分光光度法或比色法完成。

5.此步骤后尽快进行缀合。

注意:对于结合较差或失败的情况,降低 DTT  浓度可能会有所帮助。

 

.进 行 缀 合

1.每毫克IgG     添加 1 . 5毫克 SMCC-APC 。 用铝箔包裹反应管并在室温下旋转60 分钟。注意:这 些 摩 尔 比 ( 每 1gG  约 2 个 APC)  效果很好。对于失败或效果不佳的结合,不同的摩尔比可能会有所 帮助。

2.60 分钟后,必须去掉 lgG   上未反应的游离巯基。

3.在 1.0 ml 干 DMSO   中制备 10 mg  NEM  的新鲜溶液。

4.每 毫 克 |gG  添加 34μ g(3.4μl)       。 室温下包裹并旋转20 分钟。

 1.


2.60 分钟后,必须去掉 lgG   上未反应的游离巯基。

3.在 1.0 ml  干 DMSO  中制备 10  mg  NEM  的新鲜溶液。

4.每毫克 |gG 添加 34μ g(3.4μl)      。 室温下包裹并旋转20 分钟。

 

 

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