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CRISPR新品巡礼:Sigma-Aldrich[新品推荐]

发布时间:2014-08-22

  在基因组编辑方面,Sigma-Aldrich向来是个先锋。早在近十年前,它就推出了基因组编辑工具锌指核酸酶(ZFN),而在去年8月,它又率先推出了CRISPR/Cas研究工具——Sigma CRISPRs。因此论这一方面的经验,没人比Sigma-Aldrich更丰富。而这种经验在设计基因组编辑工具时尤为重要。

    在基因组编辑方面,Sigma-Aldrich向来是个先锋。早在近十年前,它就推出了基因组编辑工具锌指核酸酶(ZFN),而在去年8月,它又率先推出了CRISPR/Cas研究工具——Sigma CRISPRs。因此论这一方面的经验,没人比Sigma-Aldrich更丰富。而这种经验在设计基因组编辑工具时尤为重要。Sigma CRISPRs上线一年来,产品线也在不断丰富,下面就让我们来看看具体有哪些产品。

All-in-one的表达质粒
这个All-in-one的载体能同时表达Cas9蛋白和gRNA,而不需要使用两个载体分别表达。在这个载体上,人U6启动子驱动gRNA表达,而CMV启动子被用于表达Cas9和荧光蛋白(GFP或RFP)。他们之所以选择人U6启动子,是因为它优于H1启动子,确保了gRNA的表达效率。GFP或RFP通过2A肽段与Cas9的C端融合,实现了转染效率的追踪,也能通过FACS富集目标细胞群。对于人类、小鼠和大鼠基因组的编码区,Sigma提供预设计的CRISPR载体,可*大限度降低脱靶效应。对于其他的区域或物种,Sigma也提供定制设计服务,具体请咨询。
     今年5月,Sigma还推出了CRISPR配对切口酶(nickase)。这种高保真的CRISPR技术经过设计,可减少意外的脱靶基因修饰。传统的CRISPR会导致DNA双链断裂,但它们也容易产生脱靶的基因修饰。与此相反,一对高保真的CRISPR切口酶分别在相对的两条DNA链上产生切口,从而形成双链断裂。这种设计能明显减少脱靶的可能性,同时保持高效而又特异的基因修饰。对于干细胞研究和基因**等比较关心脱靶效应的应用,CRISPR切口酶可能更加理想。
在订购CRISPR切口酶时,我们会得到两个立即可转染的质粒,这些质粒表达gRNA,但必须注意,它们不同于上面的all-in-one载体,不表达核酸酶。Cas9-D10A切口酶必须单独订购。Sigma也同样提供预设计和定制设计的质粒。
此外,Sigma还以纯RNA的形式提供即用的gRNA,适用于显微注射或细胞培养。对于那些想建立转基因动物模型或担心质粒整合的研究人员而言,这种CRISPR RNA形式很理想。不过,这只是单独的gRNA,Cas9核酸酶必须单独购买。
阳性对照是在人EMX1基因上验证过的,可提供参照,让研究人员对其基因组编辑实验的效率进行平行的评估。目前Sigma提供即用的EMX1 positive controls for both single gRNAs(传统CRISPR)和CRISPR paired nickases(高保真CRISPR)。CRISPR通用型阴性对照则是all-in-one的转染级别质粒,表达野生型Cas9核酸酶,以及gRNA序列,不靶定已知的人类、小鼠或大鼠基因。(生物通 余亮)

 

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