洁净工程根据企业产品或工艺的选择建设洁净室的分类，洁净等级。通常洁净室分为生物洁净室与非生物洁净室。前者要保证净化系统一直处于运作状态；后者则可以提前几个小时才开启。
关于洁净工程清洁与**的工作，专业的方法为，当产品生产结束后，使用75%乙丙醇擦拭桌面、门窗、机械等。平时做到定期由专员对洁净室内设备表面及顶棚进行擦拭，使用专业的清洁剂与**剂来去除在生产过程中产生的**，控制室内微生物含量。
洁净室洁净工程中对微生物的控制主要通过净化设备系统，达到99%的空气过滤，有效排除空气中的尘埃、**、微生物等污染物。减少**产生的方法为，将室内温度控制在18-26度，湿度为45%-65%。