不同点：
一、流动相不同：HPLC为液体流动相，GC为长久性气体作流动相（通常叫做载气） 二、进样器不同：高效液相为平头进样针，气相色谱为尖头进样针 三、色谱柱长不同： （1）气相色谱柱通常几米到几十米 （气相色谱由于载气的相对分析量较低，分子间隙大，故粘度低，流动性好，组分在气相中流动速度快，因此可以增加柱长，以提高柱效）。 （2）液相色谱柱通常为几十到几百毫米 四、分析种类有差异： 气相色谱分析的对象多为（不适**）：分子质量小于1000，低沸点，易挥发，热稳定性好的化合物。 液相色谱：更适用于分析高沸点，难挥发，热稳定性差，分子质量较大（1000 - -2000）的液体化合物。 五：样品柱前变化不同：气相色谱的样品在柱前必须变为气体（气化室汽化），而液相色谱的样品在柱前则无变化。 六、所用检测器有差异： 液相主要为：紫外检测器，荧光检测器、示差折光检测器..... 气相色谱主要为：氢火焰离子化检测器（FID）,热导检测器（TCD）,电子捕获检测器（ECD）,火焰光度检测器（FPD）,氮磷检测器（NPD）..... 相同点：基本原理相同。 都是利用物质在流动相和固定相中的分配系数的差别，从而在两相间反复多次（1次，甚至更多）的分配，使原来分配系数差别很小的各组分分离开来。
气相色谱法*早出现于1952年，虽然比液相色谱晚了50年，但现已成为分离科学中较为成熟、使用*普遍、运行*容易的一种分离分析方法。它具有以下几个特点： （1）分离效率高，分离速度快，操作简便。由于气体粘度小，用其作为流动相时样品组分在两相之间可很快进行分配：气体通过盛有固定相管柱的阻力小，因此分离速度快。一根长1～2m的色谱柱，一般可有几千个理论塔板，对于长柱，甚至有一百多万个理论塔板，这样就可使一些分配系数很接近的、难以分离的物质，经过多次分配平衡，得到分离。 （2）样品用量少，检测灵敏度高。由于样品是在气态下分离和在气体中进行检测的，有许多高灵敏度的检测器可供使用，虽样品用量少也能检测出来。气相色谱可以检测出pg级的物质。 （3）选择性好。可选择对样品组分有不同作用力的液体、固体作为固定相，在适当操作温度下，使组分的分配系数有较大差异，从而将物理、化学性质相近的组分分离开。气相色谱法既可以应用于分析气体试样，也可分析易挥发或可转化为易挥发的液体和固体，不仅可分析有机物，也可分析部分无机物。 液相色谱和气相色谱相比较，在以下几个方面具有优越性： （1）气相色谱不适用于不挥发物质和对热不稳定物质，而液相色谱却不受样品的挥发性和热稳定性的限制。有些样品因为难以汽化而不能通过柱子，热不稳定的物质受热会发生分解，也不适用于气相色谱法。这使气相色谱法的使用范围受到了限制。据统计，目前气相色谱法所能分析的有机物，只占全部有机物的15%～20%。另一方面，液相色谱却不受样品的挥发性和热稳定性的限制。所以液相色谱非常适合于分离生物、医药有关的大分子和离子型化合物，不稳定的天然产物，种类繁多的其它高分子及不稳定的化合物。 （2）对于很难分离的样品，用液相色谱常比用气相色谱容易完成分离，主要有以下三个方面的原因： ①液相色谱中，由于流动相也影响分离过程，这就对分离的控制和改善提供了额外的因素。而气相色谱中的载气一般不影响分配，也就是说，在液相色谱中，有两个相与样品分子发生选择性的相互作用。 ②液相色谱中具有独特效能的柱填料（固定相）的种类较多，这样就使固定相的选择余地更大，从而增加了分离的可能性。 ③液相色谱使用较低的分离温度，分子间的相互作用在低温时更为有效，因此降低温度一般会提高色谱分离效率。 （3）和气相色谱相比，液相色谱对样品的回收比较容易，而且是定量的，样品的各个组分很容易被分离出来。因此，在很多场合，液相色谱不仅作为一种分析方法，而且可以作为一种分离手段，用以提纯和制备具有中等纯度的单一物质。在气相色谱中所分离出的各样品组分虽也可以回收，但一般都不太方便，而且定量性差。液相色谱法由于具有这些气相色谱法不具备的优点，因此在许多领域得到广泛的应用。