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RNAi知多少


RNAi知多少
随着RNAi现象的发现和研究到microRNA 成为全球生物研究者关注的热点，与其相关的各种概念不断刷新我们的认识，siRNA、shRNA、microRNA、pre-miRNA、pri-miRNA、microRNA mimic、microRNA inhibitor 、agomir、antagomir，各种RNA让刚刚接触RNAi的人头昏脑涨，那么，现在让我带大家认识一下他们各自有什么特点，有什么关系。
siRNA是dsRNA在Dicer酶作用下裂解成21-25个核苷酸的小干扰RNA，化学合成的siRNA一般正义链和反义链都是21个碱基，正义链是19个碱基的靶序列加3‘端TT悬头，反义链是19与正义链互补的碱基加3‘端TT悬头
shRNA即short hairpin RNA，shRNA表达载体在polIII启动子控制下转录的短发夹RNA，包括两个短反向重复序列，中间由一茎环（loop）序列分隔的，组成发夹结构，3‘端有UU悬头，一个已知有效的siRNA序列如果需要较长一段时间内维持沉默效应，则shRNA系统是更优选择。
成熟的miRNA是由较长的初级转录物经过一系列核酸酶的剪切加工而产生的，初级转录物称为pri-miRNA。pri-miRNA长度从几百到几千个碱基不等，带有5‘帽子和3’polyA尾巴，以及1到数个发夹径环结构。Pri-miRNA经剪切产生约70个碱基的miRNA前体，即pre-miRNA。pre-miRNA为单一发夹结构，5‘带有磷酸基团，3’有两个突出碱基，并带有3’羟基。pre-miRNA经进一步剪切，形成长度约为22个碱基的单链成熟 miRNA。
microRNA mimic是模拟活体microRNA活性来能增强内源性miRNA的功能的microRNA模拟物，化学合成有单链的也有双链的。
microRNA Inhibitor是化学合成的成熟miRNA互补单链，用来抑制内源性的microRNA的功能。特异的microRNA inhibitor能够被导入到表达特异的microRNA的细胞内，抑制microRNA的作用，也可以用来抑制表达特异的内源性的miRNA的报告载体的表达。
Agomir（microRNA激动剂）是经过特殊标记和化学修饰的双链小RNA,通过模拟内源性的microRNA来调节靶基因的生物学功能
antagomir是根据microRNA成熟体序列设计，经过特殊标记与化学修饰的单链小RNA,是专门用于抑制内源性microRNA的高效阻断剂。
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