明胶酶谱服务|实验技术服务

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测序实验流程：
酶谱法的基本过程是先将样品进行SDS-聚丙烯酰胺(SDS-PAGE，含0.1%明胶)电泳分离，然后在有二价金属离子存在的缓冲系统中使样品中的MMP-2和MMP-9恢复活性，在各自的迁移位置水解凝胶里的明胶，*后用考马斯亮蓝将凝胶染色，再脱色，在蓝色背景下可出现白色条带，条带的强弱与MMP-2和MMP-9活性成正比。
试剂的配制
(1)配制10%SDS聚丙烯酰胺凝胶(含1.0mg/ml 明胶，配好后1周内使用，明胶含量低灵敏度高)
A.分离胶的配制(注:根据你所用的电泳仪胶的大小确定配制胶的量)
10% SDS聚丙烯酰胺凝胶 10ml(包括)
ddH2O 4.5ml
30%储备胶(0.8%BIS+29.2%丙烯酰胺) 2ml
1.5mol/l Tris(PH 8.8) 2.5ml
10% SDS 100u
10%过硫酸铵(APS) 100ul
TEMED 8ul
1%明胶(1g明胶-->100ml，37°C水浴溶解) 0.5ml
B.浓缩胶的配制
浓缩胶 6ml
ddH2O 4.5ml
30%储备胶 0.75ml
1mol/l Tris-HCL( PH 6.8) 0.76ml
10% SDS 60ul
10%过硫酸铵 60ul
TEMED 6ul
(3)5×Tris –甘氨酸电极缓冲液
0.125mol/l Tris-HCL，1.25mol/l 甘氨酸，0.5%SDS(PH 8.3)
(4)4 ×上样缓冲液
0.32% Tris-HCL 6.4ml
4%SDS(PH7.2) 8ml
16%甘油 3.2 ml
溴酚蓝 0.024g
ddH2O 2.4ml
(5) 洗脱液:2.5% Triton X-100，50mmol/L Tris-HCl<6.057g/L> ，5mmol/L CaCl2<0.5549g/L>，pH7. 6 (40分钟两次，中间换液)
(6)漂洗液: 50mmol/L Tris-HCl， 5mmol/L CaCl2，pH7. 6 (20分钟2次)
(7)孵育液:50mmol/LTris,pH7.5,150mmol/LNaCl,10mmol/LCaCl2,0.02%NaN3(孵育42小时)
(8)染色液:0.05% Coomassic 亮蓝 R-250，30%甲醇，10%乙酸(染色3小时)
(9)脱色液A、B、C:甲醇浓度分别为30%、20%、10 % ,乙酸浓度分别为10 %、10 %、5% (分别30min、1h、2h脱色)
实验步骤
1.取对数期的癌细胞在的无血清培养基DMEM中培养24h。
2.次日收集上清液，将上清液移入离心管中 2000rpm 离心10min，-70℃储存备用。
3.根据细胞计数调整各组细胞培养上清液中的蛋白浓度(或者测定蛋白浓度调整使所上蛋白总量一致)。与5×上样缓冲液混合，13ul样本+4ul上样缓冲液。(不要用枪用力吹打，防止出现过多气泡)
4.配制分离胶和浓缩胶，16ul/孔上样(根据表达强度和蛋白浓度确定上样量)，4℃进行SDS-PAGE 电泳100v约1.5小时(电泳时在周围敷上冰，有利于使条带跑直)。
5.电泳结束后,将凝胶置于洗脱液(2.5% Triton X-100，50mmol/L Tris -HCl ，5mmol/L CaCl2，pH7. 6) 中振荡洗脱2次,每次40分钟,然后用漂洗液(除不含Triton X - 100 外其余同洗脱液) 漂洗2次,每次20分钟,接着,将凝胶置于孵育液( 50mmol/L Tris - HCl , 5mmol/ CaCl2 , 0. 02% Brij-35 ,pH7.6) 中37℃ 孵育42h。
6.孵育结束后经染色液(0.05% Coomassic 亮蓝、30%甲醇、10%乙酸) 染色3h,及脱色液A、B、C(甲醇浓度分别为30%、20%、10 % ,乙酸浓度分别为10 %、10 %、5%) 分别脱色0.5、1、2h后，显示出MMP-2(72KD) 和MMP -9(92 KD)为位于蓝色背景上的透亮带，用凝胶图像分析系统分析读取条带面积，宽度和灰度值，做统计分析。
注意事项
1.制备聚丙烯酰胺时应注意排除气泡 。
2.明胶酶谱的活性受钙离子，锌离子，和PH值等因素的影响，因此缓冲液 配制应严格准确，尽量用超纯水，孵育温度也掌握好。
3.用大梳子
4.孵育液的PH*好在7.5-7.6，复性的TRITON时间长了会有絮状物，所以实验时尽量使用新鲜配置的。
5.孵育的37度不要在CO2培养箱中，因为会改变孵育液的PH值，在普通孵箱即可。
6.明胶要4度保存，配好后1周内使用