微卫星(STR/SSR)分析技术服务|实验技术服务

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微卫星(STR/SSR)分析技术服务|实验技术服务——pCzn1质粒+Arctic Express宿主菌低温表达体系。
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测序实验流程：
一、背景介绍：
 微卫星标记（Microsatellite）也称为短串联重复序列（STR）或简单重复序列（SSR），是广泛分布在真核生物基因组中的简单重复序列。微卫星位点通常通过PCR扩增和电泳检测，并根据片段大小分离等位基因进行分析；扩增后的等位微卫星可以用多种方法检测，传统方法采用聚丙烯酰胺凝胶电泳加放射显影或银染的方法，费时费力效率低。阅微基因基于5年的经验，利用ABI遗传分析仪对荧光标记的DNA片段进行检测，结合分子量内标进行DNA片段长度计算，使STR分型变得高效快捷，结果也更加**。
服务编号 方法 内容说明 价格 周期
STR01 SSR引物开发 　开发未知基因组序列物种的引物 询价 2-4周
STR02 SSR引物筛选 　筛选适合荧光检测的引物 询价 2-4周
STR03 引物设计与合成 　荧光标记引物 询价 1周
STR04 PCR条件优化 　单重和多重PCR 询价 1-2周
STR05 PCR扩增 　荧光或非荧光 询价 1-4周
STR06 测序仪检测 　用测序仪对单色或多色荧光标记DNA　片段进行分离和检测 询价 2-7工作日
STR07 原始数据分析 　将原始数据分析为基因型 询价 1工作日-2周
STR08 群体遗传学分析 　关联分析、连锁图构建等 询价 1-2周
STR09 AFLP检测 　检测和数据分析 询价 2-5工作日
二、服务项目：
１．SSR引物开发 
通过富集微卫星序列，开发出20-30条具有一定重复特征的微卫星序列，并且对序列进行多态性和特异性验证。
２．引物筛选
选取部分代表性样本，利用普通引物进行PCR扩增，然后利用高分辨率芯片电泳或PAGE验证引物的特异性、扩增效率和基因座多态性等信息。
３．样本批量扩增
用带有荧光标记（FAM／HEX／TMR／ROX等）的引物，对批量样本进行PCR扩增。我公司拥有高通量PCR仪平台，可以满足大量样本扩增需求。
４．测序仪检测
带有荧光标记的PCR产物进行稀释后与分子量内标混合，用3730xl等测序仪进行毛细管电泳，并得到原始数据（。
５．原始数据分析
编制panel和bin等文件，使用正版GeneMapper v4.0软件分析测序仪得到的fsa文件，并生成PDF图谱和Excel文档（包括size、基因分型等信息），分析后的电泳图谱。
６．群体遗传学分析
利用生物信息学软件（POPGENE、MEGA、PHYLIP、ARLEQUIN等）对上述数据进行进一步分析，绘制遗传连锁图谱、分析连锁不平衡和分析多态性等。
送样要求： 细胞（≥106 ）、组织（≥300mg）、血液（≥1ml）、基因组DNA（≥20μl，浓度≥ 50ng/μl）；引物信息、片段长度范围、琼脂糖电泳图等。
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